More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2288 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
277 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  6.82389e-11 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  54.09 
 
 
745 aa  133  4e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  65.29 
 
 
973 aa  131  1e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  67.11 
 
 
1033 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  45.85 
 
 
309 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  56.25 
 
 
184 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  50.88 
 
 
449 aa  116  4e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  52.69 
 
 
576 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  50.68 
 
 
416 aa  115  8e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  52.05 
 
 
517 aa  115  1e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  41.5 
 
 
278 aa  112  7e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  54.42 
 
 
343 aa  110  2e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  54.42 
 
 
343 aa  110  2e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  45.61 
 
 
294 aa  111  2e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  47.43 
 
 
441 aa  109  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  49.32 
 
 
386 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  49.7 
 
 
299 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  44.64 
 
 
213 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  37.4 
 
 
266 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  44.13 
 
 
862 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
433 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  49.04 
 
 
320 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
216 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  43.29 
 
 
332 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  51.03 
 
 
521 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  2.37208e-05 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  44.51 
 
 
291 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  48.94 
 
 
567 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  49.66 
 
 
727 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  47.62 
 
 
291 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  43.98 
 
 
340 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  46.06 
 
 
389 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  46.39 
 
 
447 aa  102  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
311 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  44.68 
 
 
456 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  48.1 
 
 
199 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  48.92 
 
 
489 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  51.05 
 
 
381 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  40.52 
 
 
381 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  47.47 
 
 
199 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  42.22 
 
 
214 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  48.25 
 
 
241 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  44.25 
 
 
351 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  50.72 
 
 
903 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  50.66 
 
 
222 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  47.92 
 
 
234 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  45.28 
 
 
286 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  1.37449e-05  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  47.74 
 
 
256 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  48.63 
 
 
260 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  41.5 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  45.29 
 
 
204 aa  99.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  48.63 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  54.31 
 
 
294 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.72848e-05 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  51.41 
 
 
412 aa  99  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  49.02 
 
 
184 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  46.98 
 
 
245 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  43.15 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  51.13 
 
 
182 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  47.3 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  47.3 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  52.55 
 
 
418 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  61.05 
 
 
146 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  48.59 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  47.92 
 
 
182 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  44.19 
 
 
493 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  45.34 
 
 
165 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  42.94 
 
 
333 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.38 
 
 
14916 aa  96.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  40.85 
 
 
319 aa  96.3  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  46.32 
 
 
614 aa  95.9  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  43.97 
 
 
260 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  45.52 
 
 
493 aa  95.9  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  38.5 
 
 
366 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  38.5 
 
 
366 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.03936e-07 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  46.53 
 
 
189 aa  95.5  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  47.97 
 
 
356 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  47.95 
 
 
175 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  47.33 
 
 
336 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  47.33 
 
 
336 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  47.74 
 
 
203 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  40.31 
 
 
401 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  47.95 
 
 
222 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  47.26 
 
 
222 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  46.21 
 
 
446 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  44.3 
 
 
215 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  47.3 
 
 
356 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  39.47 
 
 
401 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  37.97 
 
 
366 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  38.29 
 
 
366 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  42.07 
 
 
384 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  46.45 
 
 
227 aa  93.2  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  44.81 
 
 
225 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  48.12 
 
 
176 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  36.81 
 
 
450 aa  92.8  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  47.41 
 
 
190 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  48.12 
 
 
176 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  39.42 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  43.59 
 
 
174 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  41.62 
 
 
515 aa  92.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  43.98 
 
 
194 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>