More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2816 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  85.96 
 
 		 245 aa  408  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  38 
 
 		 239 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  39.7 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  36 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  34.8 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 231 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 242 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  38.95 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 258 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 255 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  42.33 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  30.49 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  36.46 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  35.82 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 226 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  39.07 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  40.11 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>