More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4629 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 363 aa  734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  75.23 
 
 		 351 aa  511  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  63.61 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 340 aa  285  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  41.76 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  41.76 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 347 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  40.6 
 
 		 352 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  40.92 
 
 		 343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  38.69 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 365 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 333 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  29.32 
 
 		 390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  30.06 
 
 		 340 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5495  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143439  normal  0.457572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1176  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 345 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 335 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 347 aa  122  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  31.04 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3048  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.428431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  24.25 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  24.4 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  27.44 
 
 		 362 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 327 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 351 aa  99.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  27.33 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  27.25 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  26.5 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  28.2 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0267  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  23.93 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.128312  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1709  Fis family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 326 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.839551  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  23.49 
 
 		 330 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 340 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  24.69 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  26.54 
 
 		 345 aa  89.4  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 374 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  26.91 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3409  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.804556  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000628  putative transcription regulator  23.93 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  23.64 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1356  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  25.7 
 
 		 335 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 342 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1288  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 373 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0045  helix-turn-helix domain-containing protein  24.84 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  23.33 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  27.19 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  22.12 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  24.75 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>