More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3405 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 212 aa  417  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.93 
 
 		 212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.45 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.02 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  43.96 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  43.96 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  43.87 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  44.71 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  43.96 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  43.93 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  45.79 
 
 		 210 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  40.28 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2721  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.75 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0286436  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  43 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.93 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.93 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  38.65 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  37.38 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  35.26 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  34.95 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 203 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 203 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  35.07 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.74 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.47 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.9 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  36.36 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.04 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  36 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  35.03 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2902  lysine exporter protein LysE/YggA  35.41 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  37.89 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.23 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  37.84 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  34.12 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2722  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.299821  normal  0.0652266 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.28 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2160  lysine exporter protein LysE/YggA  39.42 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17805  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.35 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  33.49 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  37.3 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.071463  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.72 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.44 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.44 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16960  amino acid transporter LysE  37.16 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  31.7 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.8 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.66 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  31.7 
 
 		 222 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  34.44 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  34.44 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.44 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  34.44 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.44 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  30.73 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.44 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.44 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  31.53 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.93 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.93 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  33.49 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.74 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  32.54 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  35.1 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.51 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  32.54 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.44 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1474  hypothetical protein  36.61 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0741  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.664239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.2 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>