More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1732 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 340 aa  698    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  78.51 
 
 		 339 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 345 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  51.2 
 
 		 358 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  51.2 
 
 		 358 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 338 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  50.3 
 
 		 352 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 363 aa  285  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 365 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  42.6 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 375 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 333 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 335 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 335 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  36.14 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  29.54 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 		 352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  29.69 
 
 		 340 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  29.54 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  28.13 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 335 aa  125  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 338 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  29.39 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  29.5 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  24.02 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5495  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143439  normal  0.457572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  25.23 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  25.38 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 376 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  28.03 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  25.16 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 342 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  29.72 
 
 		 381 aa  105  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 367 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3048  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.428431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1176  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1372  transcriptional regulator, AraC family  24.2 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0658306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000628  putative transcription regulator  25.74 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  24.29 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  26.06 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  26.85 
 
 		 345 aa  95.9  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  23.97 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  24.54 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 347 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 343 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2560  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2508  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  25.39 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  25.77 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5360  AraC family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 359 aa  89.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 338 aa  89.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>