More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0631 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 418 aa  816    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  38.93 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  39.15 
 
 		 407 aa  249  5e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  38.68 
 
 		 408 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  39.29 
 
 		 412 aa  243  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  35 
 
 		 429 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  36.14 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  37.41 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  37.76 
 
 		 421 aa  236  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  36.12 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  34.99 
 
 		 426 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 427 aa  232  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  37 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  34.52 
 
 		 429 aa  224  3e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 417 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  32.84 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 		 417 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  37.88 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  37.78 
 
 		 438 aa  216  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  33.17 
 
 		 365 aa  215  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  34.3 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  38.37 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  39.6 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  36.93 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  37.04 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  39.4 
 
 		 422 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  35.55 
 
 		 373 aa  211  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  31 
 
 		 433 aa  210  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  33.66 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  38.74 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 		 378 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  38.6 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  40.24 
 
 		 412 aa  206  6e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  36.16 
 
 		 423 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  39.47 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000820178  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  34.7 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  37.64 
 
 		 412 aa  203  5e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  33.9 
 
 		 378 aa  203  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  32.11 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  34.88 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  34.95 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  33.41 
 
 		 366 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  35.61 
 
 		 368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  33.74 
 
 		 369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2503  cell cycle protein  31.25 
 
 		 438 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000231774  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2623  rod shape-determining protein RodA  37.36 
 
 		 437 aa  196  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  33.17 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  37.53 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  37.3 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  33.58 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  32.6 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  37.37 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  34.24 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  36.92 
 
 		 390 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  32.52 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  33.97 
 
 		 387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  30.88 
 
 		 369 aa  190  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  35.57 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  34.31 
 
 		 376 aa  189  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  36.68 
 
 		 373 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1392  rod shape-determining protein RodA, putative  32.77 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.011069 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  34.59 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  34.44 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  32.85 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  39.02 
 
 		 427 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  31.7 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  34.69 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  32.91 
 
 		 382 aa  186  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 368 aa  186  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  37.92 
 
 		 372 aa  186  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  32.88 
 
 		 368 aa  186  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  31.35 
 
 		 373 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  33.61 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  30.58 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  32.7 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  30.64 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  31.14 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  30.86 
 
 		 367 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  34.24 
 
 		 366 aa  183  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0743  rod shape-determining protein RodA  29.22 
 
 		 438 aa  182  8.000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0542496  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  32.84 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  33.06 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  32.68 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  34 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  33.61 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  33.61 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  34.32 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  32.17 
 
 		 374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 		 367 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20261  cell division membrane protein  34.38 
 
 		 424 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.36733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  33.79 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1152  cell division membrane protein  34.1 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  33.79 
 
 		 368 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  33.79 
 
 		 368 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  33.79 
 
 		 368 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>