More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6611 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 513 aa  1013    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103598 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  90.41 
 
 		 512 aa  903    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.456892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0229  multidrug efflux pump, MF superfamily  65.24 
 
 		 532 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1870  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.04 
 
 		 532 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0204  putative multidrug resistance protein  60.12 
 
 		 539 aa  558  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4713  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.56 
 
 		 510 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.04 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.42 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.04 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.25 
 
 		 529 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.14 
 
 		 532 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.05 
 
 		 529 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.07 
 
 		 522 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.14 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.25 
 
 		 528 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.8 
 
 		 524 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.36 
 
 		 525 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  40.12 
 
 		 525 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.72 
 
 		 532 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.92 
 
 		 531 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.78 
 
 		 530 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 		 532 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.97 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.43 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.35 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.77 
 
 		 529 aa  362  9e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.22 
 
 		 528 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.02 
 
 		 517 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.52 
 
 		 526 aa  343  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  39.51 
 
 		 529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40 
 
 		 543 aa  339  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.25 
 
 		 511 aa  336  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.31 
 
 		 516 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.8 
 
 		 536 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.35 
 
 		 523 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  39.71 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.56 
 
 		 530 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.06 
 
 		 523 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.04 
 
 		 524 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.08 
 
 		 524 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.78 
 
 		 524 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.88 
 
 		 524 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 524 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.93 
 
 		 532 aa  297  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 		 542 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 		 542 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.17 
 
 		 542 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.8 
 
 		 542 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 		 538 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.6 
 
 		 526 aa  289  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.99 
 
 		 535 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.79 
 
 		 535 aa  286  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.67 
 
 		 535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.81 
 
 		 543 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  37.21 
 
 		 529 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.74 
 
 		 526 aa  282  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  35.41 
 
 		 539 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.1 
 
 		 536 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 540 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.73 
 
 		 539 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  33.4 
 
 		 519 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.04 
 
 		 539 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  32.69 
 
 		 534 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.72 
 
 		 516 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  33.68 
 
 		 499 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.71 
 
 		 519 aa  259  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.61 
 
 		 516 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.3 
 
 		 529 aa  256  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.3 
 
 		 527 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 		 516 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 		 516 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.68 
 
 		 532 aa  249  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.99 
 
 		 535 aa  249  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 523 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 		 514 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.12 
 
 		 521 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  31.18 
 
 		 528 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.16 
 
 		 523 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 516 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 		 515 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 		 515 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 		 537 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.16 
 
 		 527 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.92 
 
 		 527 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.92 
 
 		 527 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.21 
 
 		 520 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 		 517 aa  229  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 		 517 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.17 
 
 		 535 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.83 
 
 		 528 aa  221  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.56 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.21 
 
 		 506 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  30.77 
 
 		 518 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.43 
 
 		 503 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.09 
 
 		 529 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.43 
 
 		 510 aa  217  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 		 523 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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