123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4266 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  100 
 
 
274 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  89.89 
 
 
277 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  68.9 
 
 
269 aa  351  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  64.59 
 
 
272 aa  338  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  62.55 
 
 
259 aa  322  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  60.15 
 
 
647 aa  317  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  61.39 
 
 
263 aa  315  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  60.92 
 
 
257 aa  314  8e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  55.77 
 
 
265 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  53.33 
 
 
259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  55.94 
 
 
261 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  52.31 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  55.95 
 
 
257 aa  248  8e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  53.75 
 
 
257 aa  247  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  54.51 
 
 
261 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  55.86 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  54.09 
 
 
265 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  52.78 
 
 
252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  50.58 
 
 
252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  51.42 
 
 
283 aa  225  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  50.61 
 
 
271 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  51.88 
 
 
258 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  48.44 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  52.63 
 
 
265 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  45.19 
 
 
290 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  41.67 
 
 
254 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  44.3 
 
 
249 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  42.02 
 
 
248 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  47.73 
 
 
252 aa  185  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 
264 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  40.78 
 
 
247 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  40.87 
 
 
248 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  42.41 
 
 
254 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  40.09 
 
 
251 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  44.25 
 
 
248 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 
256 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  35.56 
 
 
279 aa  158  1e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  43.7 
 
 
244 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  31.74 
 
 
253 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  38.16 
 
 
249 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
260 aa  137  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  34.73 
 
 
257 aa  133  3e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  32.43 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  32.43 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  27.83 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.98 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
275 aa  58.9  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  27.51 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  34.29 
 
 
218 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  29.23 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.69 
 
 
370 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  29.58 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  29.07 
 
 
237 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  28.93 
 
 
216 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  0.0000000954344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
321 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
321 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
321 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.5 
 
 
261 aa  52.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.68 
 
 
367 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.95 
 
 
372 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0776  protein of unknown function UPF0227  32.11 
 
 
213 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.35 
 
 
370 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0135  protein of unknown function UPF0227  28.43 
 
 
216 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.78 
 
 
368 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.32 
 
 
368 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  30.23 
 
 
260 aa  48.9  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
273 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.32 
 
 
368 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0498  hypothetical protein  27.4 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0090  carboxylesterase, putative  30.77 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  28.57 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.27 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.32 
 
 
259 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  26.37 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  23.83 
 
 
423 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  27.75 
 
 
408 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0479  hypothetical protein  25.33 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000116996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
297 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0492  hypothetical protein  25.33 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000195032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
364 aa  45.8  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  24.79 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7576  predicted protein  24.21 
 
 
162 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.30482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.32 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  35.56 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0541  hypothetical protein  25.69 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  0.956767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
313 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  31.91 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  31.82 
 
 
311 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.93 
 
 
369 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  29.35 
 
 
214 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  44 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  24.82 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  27.22 
 
 
387 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  26.83 
 
 
294 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>