126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0090 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0090  carboxylesterase, putative  100 
 
 
242 aa  507  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0479  hypothetical protein  51.45 
 
 
244 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000116996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0492  hypothetical protein  51.45 
 
 
244 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000195032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  33.06 
 
 
247 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2956  carboxylesterase  30.99 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000116225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4957  carboxylesterase  30.77 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000198319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5335  carboxylesterase  30.77 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00681619  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0449  carboxylesterase  30.65 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5244  carboxylesterase  30.36 
 
 
247 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.239449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5708  carboxylesterase  30.36 
 
 
247 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00884556  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5233  carboxylesterase  30.77 
 
 
246 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0438362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4819  carboxylesterase  30.36 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000134966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5279  carboxylesterase  30.36 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5215  carboxylesterase  30.36 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4809  carboxylesterase  30.36 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0804  esterase/lipase-like protein  30.65 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00548514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0820  carboxyesterase precursor-like protein  30.65 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4922  carboxylesterase  31.06 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00817956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3674  carboxylesterase  30.74 
 
 
247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000231487  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  28.16 
 
 
257 aa  105  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  26.64 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  26.23 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  25.41 
 
 
255 aa  94  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  27.71 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  27.27 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  27.23 
 
 
250 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  24.7 
 
 
258 aa  85.5  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  25.2 
 
 
266 aa  85.1  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  39.13 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2012  putative esterase/lipase  25.65 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121227  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0393  esterase/lipase-like protein  36.45 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  24.8 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0205  carboxylesterase precursor  26.5 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0953521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  23.79 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2020  carboxylesterase precursor  25.39 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1086  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  23.87 
 
 
733 aa  68.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  24.68 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4397  carboxylesterase  25.81 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00786026  normal  0.386096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  25.53 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  24.18 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  22.27 
 
 
274 aa  67.8  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 
283 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1552  putative esterase/lipase  23.27 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.431751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  22.17 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  23.17 
 
 
277 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  24.9 
 
 
262 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  25.71 
 
 
253 aa  62  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  29.09 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  36.36 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  23.05 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  25.86 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1336  putative carboxylesterase  32.67 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 
271 aa  58.9  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0843  hypothetical protein  31.78 
 
 
274 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338238  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  27.06 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0912  hypothetical protein  31.78 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
292 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  33.71 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  22.94 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3124  alpha/beta hydrolase fold  22.89 
 
 
281 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  26.05 
 
 
272 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.36 
 
 
736 aa  55.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  23.14 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
313 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16110  esterase/lipase  23.75 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0607403  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2553  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  22.5 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  23.18 
 
 
290 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.36 
 
 
736 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  23.18 
 
 
288 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  32.11 
 
 
257 aa  52  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3077  esterase/lipase-like  20.08 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  25.69 
 
 
401 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  31.31 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2291  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  27.62 
 
 
273 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  22.98 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1054  esterase/lipase  27.62 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0969  thermostable monoacylglycerol lipase  27.62 
 
 
273 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5263  hypothetical protein  30.77 
 
 
303 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.43 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5069  esterase/lipase-like  28.57 
 
 
271 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5791  esterase/lipase-like protein  28.57 
 
 
271 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4387  esterase/lipase-like protein  28.57 
 
 
271 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  25.83 
 
 
277 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0547  putative carboxylesterase  22.82 
 
 
269 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312098 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1329  hypothetical protein  27.12 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  27.27 
 
 
453 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  30.77 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  22.57 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1813  putative carboxylesterase  21.1 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  22.98 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  22.03 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2473  alpha/beta hydrolase fold  22.17 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0084305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>