286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4176 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  815    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4191  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 381 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7197  major facilitator superfamily permease  32.39 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  28.46 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  28.46 
 
 		 415 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  24.13 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 408 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  25.31 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  27.16 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  23.37 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  23.12 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  22.17 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  23.82 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  23.82 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  25 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  23.38 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  22.19 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  24.45 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  27.23 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5945  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  22.94 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  23.88 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0030  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.92 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.83 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  26.75 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1969  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364305  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2580  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  21.28 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 458 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 446 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 446 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  29.3 
 
 		 440 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  28.83 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  28.22 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  28.22 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2604  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.792684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  27.61 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  24.45 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  24.09 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5911  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 487 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2499  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2628  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 465 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  25.32 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  23.88 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 485 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 411 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 411 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  21.75 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  21.75 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  21.75 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  23.13 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0717  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 530 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1780  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>