243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5371 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
352 aa  714    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  62.07 
 
 
361 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2728  glycosyl transferase, group 1  59.04 
 
 
372 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1274  glycosyl transferase, group 1  50.57 
 
 
359 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204906  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3800  putative glycosyl transferase  48.73 
 
 
355 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.72 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  45.07 
 
 
360 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  49.58 
 
 
359 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  48.59 
 
 
361 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0629  glycosyl transferase, group 1  42.82 
 
 
356 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2650  glycosyl transferase, group 1  38.35 
 
 
357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0003  glycosyl transferase, group 1  43.39 
 
 
354 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
368 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  35.01 
 
 
367 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  34.55 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4264  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
364 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
371 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  30.81 
 
 
339 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0277  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
354 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0063  a-glycosyltransferase  27.16 
 
 
361 aa  126  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.15897  normal  0.0344748 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0384  glycosyl transferase  27.61 
 
 
384 aa  122  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1477  glycosyl transferase  29.07 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0984787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3645  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
828 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3298  hypothetical protein  31.06 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0661206  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.86 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  23.66 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1056  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
550 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0686  hypothetical protein  31.4 
 
 
371 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.96 
 
 
2401 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
372 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  33 
 
 
1444 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  23.31 
 
 
1121 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
372 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
1303 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3472  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 
427 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
371 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
1476 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  28.44 
 
 
415 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0315  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.35 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  23.24 
 
 
1608 aa  53.9  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 
425 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  28.71 
 
 
1147 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3647  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
384 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  hitchhiker  0.000752114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
344 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
407 aa  53.1  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
409 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
418 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
924 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.79 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
428 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
371 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
348 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
417 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
409 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  31.09 
 
 
382 aa  50.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
375 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
426 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
415 aa  50.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
519 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
360 aa  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
375 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0333  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
339 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.279236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.1 
 
 
249 aa  49.3  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 
354 aa  49.3  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5354  hypothetical protein  32.94 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
414 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  30.91 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.84 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
418 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1118  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.76 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.357165  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  23.36 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
810 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
3172 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
405 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
404 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
431 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
740 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2879  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
385 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.658622  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 
740 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.86 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5347  hypothetical protein  29.9 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2076  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249499  normal  0.0477078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
391 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>