More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3429 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 887 aa  1759    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  80.25 
 
 		 890 aa  1399    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.91 
 
 		 876 aa  436  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.9 
 
 		 481 aa  426  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  47.65 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  45.79 
 
 		 483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  47.12 
 
 		 481 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.33 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  46.39 
 
 		 480 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.7 
 
 		 493 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.74 
 
 		 482 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  44.74 
 
 		 477 aa  389  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.1 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.08 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  46.37 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.19 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.61 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.46 
 
 		 486 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.8 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  44.59 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.59 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.8 
 
 		 495 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  42.62 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  44.59 
 
 		 498 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.58 
 
 		 492 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  42.8 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.34 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4799  FAD linked oxidase domain protein  46.42 
 
 		 495 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  47.22 
 
 		 509 aa  376  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.2 
 
 		 479 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  41.7 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  42.03 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  42.36 
 
 		 492 aa  372  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  42.44 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  43.22 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  41.37 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  43.2 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.83 
 
 		 494 aa  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.47 
 
 		 493 aa  369  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  43.78 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.18 
 
 		 490 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0394  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.64 
 
 		 479 aa  369  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.413776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.34 
 
 		 488 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  43.32 
 
 		 499 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.76 
 
 		 471 aa  366  1e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.95 
 
 		 496 aa  366  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  42.49 
 
 		 499 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.77 
 
 		 488 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  42.86 
 
 		 500 aa  365  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4582  FAD linked oxidase domain protein  43.1 
 
 		 477 aa  365  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000242662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.18 
 
 		 486 aa  365  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  42.14 
 
 		 489 aa  364  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  44.05 
 
 		 503 aa  365  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  42.15 
 
 		 499 aa  364  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.99 
 
 		 492 aa  363  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.48 
 
 		 499 aa  363  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  42.24 
 
 		 499 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0049  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.64 
 
 		 656 aa  363  1e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  43.85 
 
 		 499 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.38 
 
 		 500 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3033  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.24 
 
 		 477 aa  360  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491318  normal  0.0473445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2921  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.03 
 
 		 497 aa  361  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.04 
 
 		 466 aa  361  4e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  41.32 
 
 		 499 aa  360  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  42.32 
 
 		 499 aa  360  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  42.32 
 
 		 496 aa  360  6e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.32 
 
 		 499 aa  360  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2754  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.83 
 
 		 479 aa  360  8e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.7598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  42.32 
 
 		 496 aa  360  9e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  42.92 
 
 		 466 aa  360  9e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  42.32 
 
 		 496 aa  360  9e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  42.11 
 
 		 499 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  42.11 
 
 		 499 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  41.7 
 
 		 492 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1531  FAD linked oxidase domain protein  43.17 
 
 		 482 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  44.12 
 
 		 487 aa  358  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  42.51 
 
 		 499 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  42.86 
 
 		 484 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  42.66 
 
 		 497 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.6 
 
 		 497 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.33 
 
 		 497 aa  357  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  42.38 
 
 		 499 aa  356  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.54 
 
 		 470 aa  356  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  42.38 
 
 		 499 aa  356  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  41.67 
 
 		 470 aa  355  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  41.45 
 
 		 470 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.96 
 
 		 485 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.45 
 
 		 470 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.45 
 
 		 470 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  41.79 
 
 		 497 aa  354  4e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  42.89 
 
 		 497 aa  354  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.11 
 
 		 499 aa  354  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  40.92 
 
 		 472 aa  354  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1700  putative glycolate oxidase subunit GlcD  43.41 
 
 		 483 aa  354  5e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.66 
 
 		 497 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  39.82 
 
 		 460 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  41.23 
 
 		 470 aa  353  8e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1362  FAD linked oxidase domain protein  46.43 
 
 		 488 aa  353  8e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  41.23 
 
 		 470 aa  353  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.93 
 
 		 497 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>