More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2696 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  100 
 
 		 196 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  69.46 
 
 		 213 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  69.19 
 
 		 220 aa  257  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  64.32 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  57.14 
 
 		 238 aa  240  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  78.38 
 
 		 247 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  54.04 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  55.09 
 
 		 234 aa  216  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  54.38 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  52.55 
 
 		 190 aa  185  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  47.96 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  51.02 
 
 		 190 aa  181  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  47.45 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  47.96 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  47.96 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  45.55 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  45.55 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  46.6 
 
 		 187 aa  167  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  45.6 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  44.81 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  45.6 
 
 		 191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  48.48 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  43.16 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  48.63 
 
 		 216 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  41.33 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  41.72 
 
 		 208 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  41.72 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  36.13 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  40.41 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  45.03 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  49.67 
 
 		 196 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  39.76 
 
 		 193 aa  121  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  40 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  40 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  38 
 
 		 185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  35.98 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  37.11 
 
 		 175 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  36.42 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  37.75 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  36.36 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  36.42 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.98 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  36.31 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  43.93 
 
 		 419 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  35.43 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  40.98 
 
 		 422 aa  94.7  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  34 
 
 		 152 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  37.6 
 
 		 426 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  35.66 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  40.34 
 
 		 435 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  39.05 
 
 		 439 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  38.21 
 
 		 437 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  39.05 
 
 		 455 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  37.19 
 
 		 455 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  41.27 
 
 		 264 aa  85.5  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  42.2 
 
 		 816 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  34.13 
 
 		 427 aa  85.5  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  39.09 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  34.48 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  34.62 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  29.19 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  27.98 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  35.46 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  29.72 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  34.67 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  29.29 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  38.68 
 
 		 415 aa  75.1  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  28.79 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 277 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  39.82 
 
 		 260 aa  74.7  0.0000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  35.07 
 
 		 452 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  40.77 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  40.77 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  37.31 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  38.68 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  38.68 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5025  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.47 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  35 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  29.76 
 
 		 253 aa  72  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  33.91 
 
 		 478 aa  72  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  27.09 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  30.68 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  30.28 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  39.23 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  30.81 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  30.63 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  33.86 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  34.91 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  33.97 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  33.54 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3117  polysaccharide export protein  27.78 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  38.53 
 
 		 442 aa  68.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2529  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  42.86 
 
 		 365 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  36.3 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  33.13 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.76 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>