More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1191 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  100 
 
 		 545 aa  1087    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1617  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.8 
 
 		 562 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.02 
 
 		 562 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.14 
 
 		 562 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.34 
 
 		 562 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  35.39 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.93 
 
 		 540 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.12 
 
 		 559 aa  264  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.73 
 
 		 536 aa  257  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.42 
 
 		 568 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  33.58 
 
 		 529 aa  250  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.95 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  34.74 
 
 		 549 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  34 
 
 		 528 aa  246  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  35.61 
 
 		 525 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  34.93 
 
 		 528 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  33.21 
 
 		 527 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  32.59 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  35.65 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.24 
 
 		 542 aa  239  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  32.84 
 
 		 533 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  34.82 
 
 		 539 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.8 
 
 		 565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  33.76 
 
 		 537 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  34.94 
 
 		 528 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  31.08 
 
 		 589 aa  231  3e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 551 aa  228  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  35.13 
 
 		 535 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  35.33 
 
 		 535 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  34.53 
 
 		 536 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  31.47 
 
 		 572 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  35.33 
 
 		 535 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.45 
 
 		 561 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  31.99 
 
 		 540 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  33.33 
 
 		 529 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  32.34 
 
 		 542 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  32.38 
 
 		 548 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  35.21 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  32.23 
 
 		 518 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  35.21 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  34.22 
 
 		 535 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  35.21 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  35.21 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  35.62 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  33.52 
 
 		 540 aa  217  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  33.16 
 
 		 539 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  35.44 
 
 		 539 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  34.29 
 
 		 535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  31.84 
 
 		 540 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  33.95 
 
 		 540 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2776  benzoylformate decarboxylase  29.49 
 
 		 535 aa  206  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.13 
 
 		 499 aa  205  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.62 
 
 		 566 aa  204  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  28.94 
 
 		 552 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.08 
 
 		 658 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  29.65 
 
 		 551 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1851  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3003  hypothetical protein  30.92 
 
 		 512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2432  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.54 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.34 
 
 		 565 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1406  acetolactate synthase, large subunit  26.9 
 
 		 563 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.77 
 
 		 535 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0743  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.91 
 
 		 573 aa  153  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.597512 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  24.91 
 
 		 566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0755  hypothetical protein  28.21 
 
 		 514 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1895  hypothetical protein  28.02 
 
 		 514 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.09 
 
 		 562 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.68 
 
 		 558 aa  146  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  27.16 
 
 		 591 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.54 
 
 		 563 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2212  hypothetical protein  27.95 
 
 		 518 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.976757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.87 
 
 		 574 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.19 
 
 		 596 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  26 
 
 		 550 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4676  hypothetical protein  28.65 
 
 		 553 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  23.96 
 
 		 567 aa  143  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  24.82 
 
 		 587 aa  143  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  27.7 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  26.64 
 
 		 563 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  25.18 
 
 		 587 aa  140  7e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  23.28 
 
 		 573 aa  140  7e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2090  hypothetical protein  26.9 
 
 		 518 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2811  hypothetical protein  30.42 
 
 		 551 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.193818  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  25.59 
 
 		 554 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.42 
 
 		 573 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  28.32 
 
 		 552 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  25.81 
 
 		 550 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  24.82 
 
 		 566 aa  139  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.19 
 
 		 573 aa  139  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.93 
 
 		 554 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  25.81 
 
 		 550 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2345  hypothetical protein  28 
 
 		 552 aa  139  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3896  hypothetical protein  28.18 
 
 		 513 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3488  hypothetical protein  30.09 
 
 		 555 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  23.77 
 
 		 566 aa  137  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  26.1 
 
 		 605 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.28 
 
 		 582 aa  137  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  23.16 
 
 		 599 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.41 
 
 		 556 aa  136  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.25 
 
 		 566 aa  136  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>