More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0486 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.51 
 
 
501 aa  802    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
520 aa  1050    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.98 
 
 
518 aa  791    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  83.82 
 
 
520 aa  875    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.88 
 
 
513 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.69 
 
 
513 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
527 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.52 
 
 
527 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.2 
 
 
513 aa  482  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
526 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.59 
 
 
511 aa  475  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.8 
 
 
512 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.57 
 
 
508 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.58 
 
 
512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.17 
 
 
512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.16 
 
 
509 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.55 
 
 
524 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.29 
 
 
532 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  45.95 
 
 
534 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.16 
 
 
493 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.96 
 
 
512 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.51 
 
 
511 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  46.71 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.16 
 
 
508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.03 
 
 
507 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  46.34 
 
 
507 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.34 
 
 
507 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.35 
 
 
513 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.79 
 
 
511 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  43.6 
 
 
514 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.6 
 
 
516 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.86 
 
 
529 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.7 
 
 
517 aa  361  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.72 
 
 
509 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  38.66 
 
 
561 aa  319  9e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.66 
 
 
511 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.75 
 
 
515 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2190  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.71 
 
 
514 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 
537 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.72 
 
 
517 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.92 
 
 
515 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3532  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.83 
 
 
500 aa  310  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204576  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 
520 aa  310  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
526 aa  310  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.94 
 
 
521 aa  309  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.53 
 
 
510 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.53 
 
 
503 aa  306  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 
532 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.46 
 
 
530 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.29 
 
 
522 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 
530 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 
530 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 
530 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  36.13 
 
 
526 aa  300  6e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 
517 aa  299  8e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.17 
 
 
530 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  35.9 
 
 
526 aa  297  4e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.44 
 
 
534 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.41 
 
 
534 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.75 
 
 
525 aa  296  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  32.04 
 
 
495 aa  296  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  31.8 
 
 
496 aa  296  7e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 
539 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 
539 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  32.17 
 
 
539 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33 
 
 
529 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  31.98 
 
 
539 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  31.98 
 
 
539 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.98 
 
 
539 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  31.98 
 
 
539 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.65 
 
 
532 aa  288  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.33 
 
 
509 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.33 
 
 
509 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 
506 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 
526 aa  272  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.64 
 
 
511 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 
519 aa  269  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.62 
 
 
516 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  31.04 
 
 
518 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  32.49 
 
 
511 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  32.49 
 
 
511 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.49 
 
 
511 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  32.49 
 
 
512 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  32.43 
 
 
512 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  32.22 
 
 
512 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  32.22 
 
 
512 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.27 
 
 
511 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.02 
 
 
511 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31 
 
 
537 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  32.22 
 
 
512 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
520 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  32.73 
 
 
512 aa  251  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.73 
 
 
512 aa  251  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  32.73 
 
 
512 aa  251  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 
520 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 
520 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  32.73 
 
 
512 aa  251  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.73 
 
 
512 aa  251  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0123748 
 
 
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NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.14 
 
 
515 aa  251  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  32.73 
 
 
512 aa  251  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
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