71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1789 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  75.14 
 
 		 181 aa  292  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  71.19 
 
 		 177 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  71.43 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  61.76 
 
 		 186 aa  217  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  60.34 
 
 		 189 aa  214  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  50.3 
 
 		 176 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  42.26 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  43.4 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  42.11 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  41.86 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  38.1 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  37.5 
 
 		 176 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  33.91 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  35.45 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  34.02 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  34.97 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  34.39 
 
 		 210 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  35.63 
 
 		 191 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  38.73 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  32.45 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  33.33 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  29.65 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  30.27 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  32.26 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  28.32 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  30.56 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  26.86 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  30.56 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  27.43 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  26.97 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  30.17 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  29.21 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  31.21 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  37.5 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  43.55 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  31.43 
 
 		 140 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  43.55 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  45.28 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  28.57 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0837  hypothetical protein  25 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21812  normal  0.663687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  32.61 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  32.43 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  39.34 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  24.32 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  41.07 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  43.4 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  41.07 
 
 		 155 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  41.07 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  41.07 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  41.07 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  41.07 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  41.07 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  27.65 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  35.38 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  33.33 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2268  hypothetical protein  24.31 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.771496 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  40.82 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  41.51 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  34.92 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  31.58 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  33.33 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  32.93 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  40 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2497  TadE-like  30 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0206754  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  37.04 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  40.43 
 
 		 153 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  30.16 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3442  hypothetical protein  21.08 
 
 		 186 aa  40.8  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0907712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>