More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4230 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  52.45 
 
 
769 aa  702  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  54.05 
 
 
766 aa  719  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  53.1 
 
 
760 aa  732  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 
769 aa  692  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  69.74 
 
 
789 aa  1063  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  96.35 
 
 
767 aa  1367  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  52.78 
 
 
769 aa  703  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  86.16 
 
 
755 aa  1257  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  69.2 
 
 
769 aa  994  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  56.03 
 
 
763 aa  788  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  75.38 
 
 
793 aa  884  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  52.15 
 
 
769 aa  692  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  52.32 
 
 
804 aa  732  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  52.71 
 
 
769 aa  700  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  97.91 
 
 
762 aa  1393  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
765 aa  1506  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  58.33 
 
 
768 aa  846  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  76.75 
 
 
764 aa  1117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  52.45 
 
 
769 aa  702  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  69.28 
 
 
764 aa  999  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
808 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  51.28 
 
 
864 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  52.19 
 
 
832 aa  614  1e-174  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  51.57 
 
 
864 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  51.72 
 
 
864 aa  615  1e-174  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  51.57 
 
 
864 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  51.57 
 
 
864 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  51.57 
 
 
864 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  55.81 
 
 
1079 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 
896 aa  583  1e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  45.12 
 
 
752 aa  566  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  48.87 
 
 
896 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
742 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  32.21 
 
 
734 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
741 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
679 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
679 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
740 aa  333  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
762 aa  330  5e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
2539 aa  326  9e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  39.32 
 
 
878 aa  323  6e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
772 aa  323  1e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
784 aa  316  8e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  29.31 
 
 
764 aa  315  2e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.15 
 
 
769 aa  313  6e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.95 
 
 
769 aa  313  7e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
686 aa  309  1e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  29.33 
 
 
2336 aa  308  2e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.43 
 
 
769 aa  308  2e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
801 aa  307  4e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
2423 aa  307  5e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
783 aa  306  1e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.38 
 
 
1971 aa  305  2e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  37.02 
 
 
2458 aa  303  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  36.48 
 
 
2476 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.63 
 
 
1992 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  29.64 
 
 
774 aa  294  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
1646 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
1646 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  29.35 
 
 
1987 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
1629 aa  288  3e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
2212 aa  288  3e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
781 aa  287  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
1647 aa  286  1e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
777 aa  285  2e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  29.54 
 
 
2301 aa  285  2e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
705 aa  284  5e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
777 aa  283  7e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
865 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
865 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  34.1 
 
 
770 aa  281  4e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  28.43 
 
 
798 aa  281  4e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  28.38 
 
 
2301 aa  280  8e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  35.91 
 
 
770 aa  280  1e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
1609 aa  278  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  37 
 
 
777 aa  277  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 
1725 aa  276  8e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.1 
 
 
1956 aa  276  1e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
705 aa  276  1e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 
1725 aa  275  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
756 aa  275  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
1155 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
1758 aa  271  3e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.47 
 
 
783 aa  271  3e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.4 
 
 
785 aa  269  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
607 aa  267  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.40814e-08 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  30.21 
 
 
2048 aa  267  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
974 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
1974 aa  267  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
1127 aa  267  6e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  33.6 
 
 
839 aa  267  7e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  27.55 
 
 
2284 aa  267  7e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
758 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
706 aa  266  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
1907 aa  266  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  30.28 
 
 
601 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
1832 aa  264  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
707 aa  265  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  28.63 
 
 
764 aa  264  5e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
652 aa  264  5e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>