274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4013 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  69.15 
 
 		 484 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  98.76 
 
 		 484 aa  956    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  85.12 
 
 		 484 aa  815    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  73.76 
 
 		 483 aa  676    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  80.79 
 
 		 484 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  85.74 
 
 		 484 aa  824    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  90.91 
 
 		 484 aa  874    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  69.15 
 
 		 484 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  100 
 
 		 484 aa  965    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  69.57 
 
 		 484 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  94.83 
 
 		 484 aa  900    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  81.2 
 
 		 484 aa  770    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  70.19 
 
 		 484 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  68.94 
 
 		 484 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  69.21 
 
 		 483 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  98.76 
 
 		 484 aa  956    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  51.04 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  51.87 
 
 		 481 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  51.45 
 
 		 481 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  51.77 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  51.24 
 
 		 480 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  50.62 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  50.62 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  49.79 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  49.79 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  50.83 
 
 		 480 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  49.79 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  49.79 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  49.38 
 
 		 480 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  49.38 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  49.17 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  49.58 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  49.69 
 
 		 480 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  50.21 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  48.34 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  48.65 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  50.47 
 
 		 472 aa  415  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  46.97 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  51.33 
 
 		 493 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  47.94 
 
 		 498 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  38.96 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  40.08 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  42.95 
 
 		 485 aa  361  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  37.55 
 
 		 482 aa  353  5e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  43.12 
 
 		 498 aa  346  5e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  39.35 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  41.37 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  38.41 
 
 		 500 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  38.54 
 
 		 466 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  39.33 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  38.22 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  37.26 
 
 		 481 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  39.4 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.91 
 
 		 483 aa  300  4e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  36.98 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  38.64 
 
 		 483 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  37.42 
 
 		 491 aa  296  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  33.82 
 
 		 482 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  33.82 
 
 		 482 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  36.53 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.63 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  34.98 
 
 		 482 aa  292  8e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  38.52 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  36.33 
 
 		 498 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  37.58 
 
 		 485 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.98 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.59 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  35.17 
 
 		 485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  37.86 
 
 		 485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  36.66 
 
 		 484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.46 
 
 		 484 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  37.35 
 
 		 488 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  37.98 
 
 		 488 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  35.73 
 
 		 485 aa  282  9e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  40.99 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  37.08 
 
 		 510 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  35.41 
 
 		 484 aa  281  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  34.6 
 
 		 479 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.88 
 
 		 483 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  37.42 
 
 		 494 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  36.4 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  37.24 
 
 		 486 aa  277  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  37.01 
 
 		 484 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  37.37 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  41.07 
 
 		 484 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  34.78 
 
 		 481 aa  276  5e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.31 
 
 		 483 aa  276  7e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.89 
 
 		 485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  33.33 
 
 		 466 aa  273  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  36.55 
 
 		 486 aa  273  6e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  35.32 
 
 		 485 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  37.1 
 
 		 485 aa  270  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.31 
 
 		 482 aa  270  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0877  cation transporter  35.49 
 
 		 483 aa  268  1e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  37.39 
 
 		 485 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  37.39 
 
 		 485 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  36.12 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  38.88 
 
 		 485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  36.32 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  33.54 
 
 		 483 aa  267  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>