142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2613 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  100 
 
 		 369 aa  765    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  49.73 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  49.73 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  44.69 
 
 		 370 aa  322  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  44.41 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  43.72 
 
 		 363 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  44.54 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  44.59 
 
 		 364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  38.77 
 
 		 416 aa  285  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  44.2 
 
 		 378 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  41.07 
 
 		 370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  40.49 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  42.51 
 
 		 370 aa  279  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  40.36 
 
 		 378 aa  279  7e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  42.25 
 
 		 384 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  40.94 
 
 		 377 aa  273  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  42.32 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  40.59 
 
 		 362 aa  270  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  39.89 
 
 		 378 aa  270  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  42.62 
 
 		 357 aa  268  8.999999999999999e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  37.23 
 
 		 368 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  39.89 
 
 		 369 aa  255  8e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  38.61 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  35.85 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  27.32 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.32 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.52 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  28.38 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  34.03 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  27.96 
 
 		 394 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  26.94 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  26.65 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  26.17 
 
 		 398 aa  96.3  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  24.93 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  25.89 
 
 		 399 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  26.02 
 
 		 365 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  24.66 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  22.45 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  30.52 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  29.92 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  22.81 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  26.34 
 
 		 584 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  23.67 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  21.91 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  22.32 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  23.9 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  25 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  24.5 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  23.33 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  22.69 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  23.2 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  23.2 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  22.88 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  23.16 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  23.44 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  22.4 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  27.23 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  23.58 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  25.27 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  23.56 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.25 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  24.74 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  23.85 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  23.23 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  22.59 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  22.98 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  22.79 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  23.85 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  24.23 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  22.6 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  23.51 
 
 		 392 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  36.21 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  23.85 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  22.98 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  23.91 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  22.4 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  23.91 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  22.73 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  22.22 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  24.06 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  23.94 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  23.04 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  28.57 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  23.21 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  23.53 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  23.76 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  23.2 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  22.78 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  22.14 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  23.4 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  21.88 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  22.61 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  22.04 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  23.56 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0539  SMC domain-containing protein  22.56 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  19.2 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  21.61 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  18.93 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  36.26 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  23.28 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>