More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0079 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0079  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 241 aa  493  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  94.44 
 
 		 422 aa  345  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  48.04 
 
 		 411 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  48.6 
 
 		 411 aa  175  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  50.3 
 
 		 400 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  47.95 
 
 		 406 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  50 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  46.93 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  49.12 
 
 		 411 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  46.37 
 
 		 403 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  49.41 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  47.95 
 
 		 411 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  47.65 
 
 		 402 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  46.37 
 
 		 411 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  45.81 
 
 		 403 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  48.82 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  46.63 
 
 		 402 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  46.63 
 
 		 402 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  45.51 
 
 		 402 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  46.63 
 
 		 402 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  47.65 
 
 		 348 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  47.65 
 
 		 348 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  48.21 
 
 		 402 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  45.61 
 
 		 413 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  47.65 
 
 		 402 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  46.63 
 
 		 387 aa  162  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  46.63 
 
 		 382 aa  161  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  46.63 
 
 		 382 aa  161  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  46.63 
 
 		 402 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  46.07 
 
 		 402 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  46.63 
 
 		 402 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  47.46 
 
 		 431 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  46.63 
 
 		 422 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  46.07 
 
 		 402 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  46.07 
 
 		 402 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  45.66 
 
 		 435 aa  158  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  48.1 
 
 		 408 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  48.1 
 
 		 408 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  44.63 
 
 		 381 aa  156  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  44.71 
 
 		 399 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  44.07 
 
 		 381 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  43.96 
 
 		 424 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  41.04 
 
 		 397 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  41.04 
 
 		 397 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.11 
 
 		 398 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.25 
 
 		 396 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.18 
 
 		 396 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2570  transposase, IS605 OrfB family  37.5 
 
 		 410 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373055  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  39.18 
 
 		 399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  39.18 
 
 		 399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.43 
 
 		 403 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.68 
 
 		 403 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  40.35 
 
 		 391 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.78 
 
 		 401 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  40.35 
 
 		 391 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  38.37 
 
 		 417 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  40.85 
 
 		 390 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  38.15 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  36.42 
 
 		 406 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  39.18 
 
 		 391 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  38.92 
 
 		 395 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.55 
 
 		 399 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  41.84 
 
 		 406 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  42.55 
 
 		 399 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  33.14 
 
 		 424 aa  104  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  46.55 
 
 		 517 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  40.43 
 
 		 399 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  40.43 
 
 		 399 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.64 
 
 		 361 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  36.84 
 
 		 415 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  39.55 
 
 		 398 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  39.55 
 
 		 398 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1890  transposase OrfB  39.55 
 
 		 335 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  33.53 
 
 		 401 aa  102  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  35.93 
 
 		 368 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  39.75 
 
 		 381 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  43.33 
 
 		 403 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  37.3 
 
 		 399 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  39.66 
 
 		 383 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  41.24 
 
 		 398 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  38.65 
 
 		 403 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  36.67 
 
 		 416 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  37.5 
 
 		 399 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0723  ISCpe2, transposase orfB  34.32 
 
 		 384 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  33.73 
 
 		 384 aa  99  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  40.76 
 
 		 363 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  36.53 
 
 		 399 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  33.73 
 
 		 384 aa  99  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2046  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  38.01 
 
 		 424 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0126  ISCpe2, transposase orfB  33.73 
 
 		 384 aa  98.6  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0547  ISCpe2, transposase orfB  33.73 
 
 		 384 aa  98.6  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  40.13 
 
 		 363 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0472  ISCpe2, transposase orfB  33.73 
 
 		 384 aa  98.6  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0168  ISCpe2, transposase orfB  33.73 
 
 		 384 aa  98.2  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0245  ISCpe2, transposase orfB  33.73 
 
 		 384 aa  98.6  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0772  ISCpe2, transposase orfB  33.73 
 
 		 383 aa  98.6  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  38.73 
 
 		 380 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1266  IS605 family transposase OrfB  38.42 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  33.73 
 
 		 384 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  33.73 
 
 		 384 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>