More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4338 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  100 
 
 		 208 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  77.4 
 
 		 209 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  75.36 
 
 		 208 aa  333  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  73.43 
 
 		 207 aa  324  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  74.15 
 
 		 218 aa  316  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  73.66 
 
 		 207 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  71.15 
 
 		 208 aa  304  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  72.41 
 
 		 208 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  69.8 
 
 		 211 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  68.12 
 
 		 208 aa  288  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  65.22 
 
 		 213 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  62.44 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  60.1 
 
 		 208 aa  231  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  34.85 
 
 		 1287 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  34.98 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  30.52 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  31.22 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  29.1 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  29.38 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  33.12 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  37.8 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  33.53 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  25.77 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.74 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  32.74 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  37.88 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  27.7 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  27.78 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  27.7 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  31.21 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  33.09 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  27.01 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  29.56 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  29.56 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  29.35 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54050  hypothetical protein  29.05 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  32.14 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.29 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  32.14 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  26.11 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  28.15 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2488  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  28.98 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.91 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  40.78 
 
 		 423 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  30.06 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  30 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  29.44 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  34.21 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  27.73 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  30.49 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  36.27 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  31.69 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 303 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1564  conserved hypothetical protein, possible methyltransferase  24.11 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  28.04 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3642  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 355 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000500593  decreased coverage  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  30.69 
 
 		 440 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.24 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 348 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  37.14 
 
 		 323 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  25 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.23 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  29.11 
 
 		 629 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>