More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0648 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
661 aa  1348    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  37.38 
 
 
774 aa  279  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1069 aa  275  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
772 aa  267  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
775 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
1596 aa  267  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  36.42 
 
 
771 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
600 aa  266  8e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
587 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
911 aa  266  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  35.73 
 
 
790 aa  266  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  35.8 
 
 
771 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
779 aa  263  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
769 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
774 aa  259  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
784 aa  258  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
769 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
786 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  34.99 
 
 
786 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  35.81 
 
 
783 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
769 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
627 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  35.81 
 
 
783 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
770 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.61 
 
 
786 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
782 aa  250  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
775 aa  249  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
778 aa  249  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
643 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
764 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
646 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
607 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  38.5 
 
 
648 aa  242  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
605 aa  242  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
612 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
617 aa  239  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
573 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1350 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
797 aa  236  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.34 
 
 
562 aa  234  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2369  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
793 aa  233  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315374 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  32.12 
 
 
773 aa  232  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  41.78 
 
 
503 aa  230  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 
717 aa  230  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
513 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
614 aa  228  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
795 aa  228  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.43 
 
 
583 aa  227  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.62 
 
 
798 aa  227  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
773 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
1118 aa  223  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
606 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 
579 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
1157 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
630 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.98 
 
 
620 aa  219  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.2 
 
 
844 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
989 aa  218  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
947 aa  218  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 
989 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
763 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
1363 aa  216  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
605 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
1501 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 
1266 aa  216  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
747 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
468 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1352 aa  211  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
969 aa  211  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
494 aa  210  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 
955 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
1433 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  40.63 
 
 
525 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 
523 aa  209  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
1009 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
973 aa  208  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
881 aa  207  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 
502 aa  206  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1578 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 
1044 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  49.79 
 
 
508 aa  205  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  31.04 
 
 
1560 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  36.76 
 
 
1046 aa  205  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
984 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 
530 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.44 
 
 
484 aa  205  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1611 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1193 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1193 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 
1068 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
862 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  30.1 
 
 
685 aa  203  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
582 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
928 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
1064 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
780 aa  203  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 
1195 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 
531 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
568 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>