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for query gene Ping_3088 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  100 
 
 		 198 aa  414  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 196 aa  215  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  48.7 
 
 		 193 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 211 aa  161  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  152  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  39.44 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 204 aa  147  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  34.38 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 205 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  35.87 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  40.52 
 
 		 162 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  35.14 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  38.12 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  34.97 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 209 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 201 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 247 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  34.64 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 311 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 194 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 198 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 212 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  31.44 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  94.4  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
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NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
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NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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