More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4147 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
1230 aa  2501    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6300  histidine kinase  28.24 
 
 
1255 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3020  histidine kinase  26.4 
 
 
1282 aa  328  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883771  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2197  two-component sensor histidine kinase (sensor protein AtoS)  25.38 
 
 
1234 aa  301  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.993549 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  36.1 
 
 
470 aa  268  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  39.71 
 
 
471 aa  244  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  31.59 
 
 
1347 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  34.7 
 
 
484 aa  228  8e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  31.56 
 
 
573 aa  167  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  34.39 
 
 
581 aa  163  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
581 aa  161  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
594 aa  161  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
581 aa  152  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
733 aa  146  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
610 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1110  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
508 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230539  normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  33.05 
 
 
748 aa  142  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
736 aa  141  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
748 aa  138  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
518 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
746 aa  135  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
752 aa  135  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
516 aa  135  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  28.77 
 
 
484 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
731 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
756 aa  132  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
756 aa  132  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
753 aa  132  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1927  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
596 aa  132  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
768 aa  131  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1130  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
525 aa  131  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.351901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  27.7 
 
 
673 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1199  histidine kinase  32.18 
 
 
525 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.893151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
749 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
756 aa  130  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  30.51 
 
 
734 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
710 aa  129  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
742 aa  129  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
516 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
734 aa  128  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0604  histidine kinase  30.28 
 
 
516 aa  128  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
760 aa  128  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1071  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
498 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  31.86 
 
 
705 aa  127  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
741 aa  127  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
845 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.468501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
747 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2269  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
736 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00414095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
738 aa  126  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  28.49 
 
 
471 aa  125  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
656 aa  125  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  28.39 
 
 
656 aa  125  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  29.11 
 
 
712 aa  124  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  26.6 
 
 
674 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
765 aa  122  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
779 aa  121  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
471 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 
671 aa  121  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
737 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
753 aa  119  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
655 aa  119  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0704  sensor histidine kinase  29.2 
 
 
713 aa  119  3e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.2301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
756 aa  119  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
725 aa  119  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
532 aa  118  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
469 aa  118  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1116  nitrogen regulation protein NtrY  29.11 
 
 
774 aa  118  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
756 aa  118  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1074  nitrogen regulation protein NtrY  29.11 
 
 
774 aa  118  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000929955  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
372 aa  118  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
655 aa  117  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
757 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
729 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0024  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
736 aa  117  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.10248 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0542  nitrogen regulation protein NtrY  28.27 
 
 
742 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0128365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4001  histidine kinase  28.57 
 
 
774 aa  117  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000232996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0023  nitrogen regulation protein NtrY, putative  30 
 
 
710 aa  117  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736908  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
671 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
708 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
378 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
756 aa  116  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  29.13 
 
 
714 aa  116  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
367 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
799 aa  115  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
763 aa  115  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
525 aa  115  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
773 aa  114  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
762 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
762 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
772 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  30.3 
 
 
608 aa  114  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.3 
 
 
608 aa  114  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  28.86 
 
 
655 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  29.19 
 
 
581 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
718 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
784 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  30.3 
 
 
608 aa  114  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
764 aa  113  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  30.3 
 
 
608 aa  114  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>