218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2791 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1298    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  45 
 
 		 724 aa  538  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  45.4 
 
 		 665 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  44.03 
 
 		 712 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  44.03 
 
 		 712 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  42.51 
 
 		 672 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  42.51 
 
 		 672 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  42.51 
 
 		 672 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  42.51 
 
 		 672 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  42.67 
 
 		 672 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  42.4 
 
 		 695 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  42.35 
 
 		 672 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  42.51 
 
 		 672 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  45.02 
 
 		 659 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  43.57 
 
 		 671 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  43.4 
 
 		 624 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  42.32 
 
 		 673 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  42.32 
 
 		 673 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  42.32 
 
 		 673 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 		 698 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  45.18 
 
 		 660 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 697 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  43.06 
 
 		 628 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 		 697 aa  492  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 697 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  45.02 
 
 		 659 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  40.12 
 
 		 697 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  43.3 
 
 		 671 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  39.51 
 
 		 697 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  38.07 
 
 		 673 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  41.8 
 
 		 684 aa  465  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  32.59 
 
 		 373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  25.88 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  25.49 
 
 		 306 aa  105  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  29.54 
 
 		 319 aa  96.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  26.6 
 
 		 298 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 278 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  25.94 
 
 		 256 aa  89.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 		 282 aa  88.2  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  29.78 
 
 		 645 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  24.71 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  26.89 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  25.47 
 
 		 319 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  24.82 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 615 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 615 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.6 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2279  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 349 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  25.35 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  25.35 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  25.35 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 262 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 		 627 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  25 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  33.88 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  24.88 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  21.62 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  28.81 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  23.9 
 
 		 258 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.79 
 
 		 237 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  23.3 
 
 		 342 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.79 
 
 		 319 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 348 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  26.05 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  22.47 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 347 aa  72  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  24.3 
 
 		 273 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  21.56 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  26.89 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 		 370 aa  72  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  26.42 
 
 		 274 aa  70.1  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2763  hypothetical protein  28.23 
 
 		 395 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.14621e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  22.88 
 
 		 271 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  23.92 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  22.61 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  27.13 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  27.13 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  27.13 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  22.71 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  27.23 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  27.13 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  23.61 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>