35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2763 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2763  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  790    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.14621e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  28.41 
 
 		 665 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  28.23 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  25.44 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  25.44 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  25.44 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  25.44 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  25.44 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  25.44 
 
 		 672 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  24.71 
 
 		 673 aa  70.1  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  25.79 
 
 		 673 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  25.79 
 
 		 673 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  25.79 
 
 		 673 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  24.57 
 
 		 697 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  26.5 
 
 		 671 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  25.92 
 
 		 698 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  23.41 
 
 		 697 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 		 697 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  25.35 
 
 		 697 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  25.72 
 
 		 724 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 		 695 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  26.01 
 
 		 671 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  24.22 
 
 		 697 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  25.56 
 
 		 659 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  23.9 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  24.09 
 
 		 624 aa  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  23.03 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  26.11 
 
 		 660 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  21.22 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 		 659 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  26.04 
 
 		 684 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  24.36 
 
 		 628 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>