283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1048 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  43.87 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  43.49 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  43.66 
 
 		 272 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  43.49 
 
 		 274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  44.69 
 
 		 273 aa  211  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  41.64 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  40.89 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  34.12 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  35.07 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  36.73 
 
 		 291 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  36.16 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  35.79 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  35.42 
 
 		 291 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  30.34 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  32.46 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  36.8 
 
 		 357 aa  139  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  32.71 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  34.02 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  34.51 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  32.93 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  39.37 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  32.09 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  32.02 
 
 		 299 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  30.63 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  28.79 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  32.49 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  30.4 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  31.56 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  34.52 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  36.6 
 
 		 315 aa  112  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  30.83 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  33.89 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  30.66 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  31.5 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  30.45 
 
 		 369 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  34.34 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  35.18 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  30.83 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  29.34 
 
 		 367 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  37.08 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  30.59 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  30.63 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  33.51 
 
 		 348 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  35.44 
 
 		 351 aa  104  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  32.1 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  29.34 
 
 		 356 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.35 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  29.34 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  32.43 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  31.56 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  29.73 
 
 		 355 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  33.99 
 
 		 407 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  33.84 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  37.27 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  28.96 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  28.96 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  34.67 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  28.96 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 		 288 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  22.46 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 		 346 aa  99  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  22.51 
 
 		 283 aa  99  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  34.67 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 357 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 357 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 357 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  32.69 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 357 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 357 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 357 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 359 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  29.36 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  35.68 
 
 		 288 aa  97.8  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 357 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  33.85 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  33.85 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 414 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  33.85 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  34.59 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>