More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0388 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  56.42 
 
 		 570 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  54.78 
 
 		 577 aa  638    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  54.26 
 
 		 570 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  100 
 
 		 594 aa  1195    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  57.92 
 
 		 582 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  62.67 
 
 		 589 aa  729    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  56.39 
 
 		 584 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  61.99 
 
 		 574 aa  696    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  58.54 
 
 		 637 aa  665    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  55.01 
 
 		 585 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  53.46 
 
 		 586 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  54.61 
 
 		 587 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  54.31 
 
 		 569 aa  621  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  54.42 
 
 		 612 aa  618  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  54.61 
 
 		 586 aa  618  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  55.22 
 
 		 574 aa  611  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  55.24 
 
 		 586 aa  609  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  55.24 
 
 		 586 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  56.03 
 
 		 586 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  56.03 
 
 		 586 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  54.35 
 
 		 574 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  54.71 
 
 		 586 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  55.56 
 
 		 585 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  55.6 
 
 		 586 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  54.35 
 
 		 586 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  55.06 
 
 		 586 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  54.53 
 
 		 586 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  54.53 
 
 		 586 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  54.87 
 
 		 575 aa  594  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  55.12 
 
 		 577 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  51.73 
 
 		 578 aa  568  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.41 
 
 		 558 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.19 
 
 		 558 aa  458  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.96 
 
 		 568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  42.86 
 
 		 871 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  44.34 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.5 
 
 		 553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.43 
 
 		 568 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.23 
 
 		 568 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  41.7 
 
 		 568 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  43.27 
 
 		 556 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42 
 
 		 563 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.08 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.91 
 
 		 568 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  42.14 
 
 		 568 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.73 
 
 		 568 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  40.21 
 
 		 561 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.6 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.38 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.48 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.38 
 
 		 568 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.01 
 
 		 557 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  40.67 
 
 		 571 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.5 
 
 		 557 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  41.01 
 
 		 573 aa  428  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  37.95 
 
 		 787 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.81 
 
 		 568 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  42.08 
 
 		 577 aa  422  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  41.48 
 
 		 559 aa  420  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.89 
 
 		 570 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.87 
 
 		 553 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.28 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  41.64 
 
 		 591 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.08 
 
 		 564 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  46.36 
 
 		 520 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  39.86 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.53 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  40.84 
 
 		 561 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  41.02 
 
 		 577 aa  415  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.95 
 
 		 520 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  40.6 
 
 		 555 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.11 
 
 		 553 aa  411  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 554 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  42.61 
 
 		 561 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  43.51 
 
 		 520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  39.11 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  44.27 
 
 		 521 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  42.01 
 
 		 572 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  41.26 
 
 		 885 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.83 
 
 		 520 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  36.88 
 
 		 562 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  41.28 
 
 		 564 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  39.71 
 
 		 558 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  41.55 
 
 		 603 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  40.74 
 
 		 573 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  39.72 
 
 		 891 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  37.41 
 
 		 563 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  39.33 
 
 		 567 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  47.1 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  39.89 
 
 		 888 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  41.11 
 
 		 599 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  40.94 
 
 		 599 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  41.29 
 
 		 599 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  40.61 
 
 		 563 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  44.06 
 
 		 515 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  40.7 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  46.07 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  45.63 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  43.57 
 
 		 522 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  44.87 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>