More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0030 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 634 aa  1283    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  82.99 
 
 		 635 aa  1109    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  84.07 
 
 		 640 aa  1118    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  85.02 
 
 		 634 aa  1108    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  50.63 
 
 		 636 aa  619  1e-176  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  41.82 
 
 		 635 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  41.77 
 
 		 639 aa  491  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  43.03 
 
 		 630 aa  486  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  44.64 
 
 		 629 aa  488  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  42.02 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  42.26 
 
 		 635 aa  475  1e-132  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  43.29 
 
 		 642 aa  473  1e-132  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  39.57 
 
 		 637 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  42.41 
 
 		 639 aa  469  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  40.19 
 
 		 636 aa  462  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  41.3 
 
 		 636 aa  465  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  39.16 
 
 		 641 aa  457  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  39.01 
 
 		 647 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  37.06 
 
 		 644 aa  439  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  37.05 
 
 		 641 aa  438  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  37.76 
 
 		 640 aa  434  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 		 635 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  38.22 
 
 		 635 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 635 aa  434  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 		 635 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  36.29 
 
 		 644 aa  434  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  36.73 
 
 		 646 aa  428  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  38.22 
 
 		 635 aa  429  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  38.16 
 
 		 634 aa  422  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  35.98 
 
 		 426 aa  292  1e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  35.01 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  35.01 
 
 		 422 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 		 422 aa  267  5e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  35.67 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.3 
 
 		 541 aa  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  32.9 
 
 		 821 aa  229  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  32.91 
 
 		 432 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  33.47 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 		 830 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.03 
 
 		 540 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  31.25 
 
 		 476 aa  220  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  31.3 
 
 		 455 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  33.27 
 
 		 531 aa  219  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  33.26 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  34.2 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 		 433 aa  217  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  30.67 
 
 		 470 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  29.4 
 
 		 467 aa  216  7e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.74 
 
 		 543 aa  216  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  33.91 
 
 		 433 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 460 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  31.37 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 464 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 		 477 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 		 464 aa  211  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  31.59 
 
 		 455 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  31.59 
 
 		 455 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.09 
 
 		 465 aa  210  8e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  30.74 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.85 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  32.4 
 
 		 433 aa  206  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  32.16 
 
 		 468 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.71 
 
 		 467 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  29.9 
 
 		 468 aa  205  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.53 
 
 		 536 aa  204  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  35.54 
 
 		 425 aa  204  5e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 		 544 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  31.04 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  30.72 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 525 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  32.46 
 
 		 470 aa  201  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 455 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  30.41 
 
 		 455 aa  201  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  30.72 
 
 		 452 aa  200  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  31.81 
 
 		 451 aa  200  7e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 		 476 aa  200  7.999999999999999e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  28.84 
 
 		 467 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 570 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  30.5 
 
 		 472 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  30.31 
 
 		 603 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 535 aa  198  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 		 428 aa  198  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  29.9 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  29.05 
 
 		 467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  30.29 
 
 		 472 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  30.29 
 
 		 472 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  30.29 
 
 		 472 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  31.68 
 
 		 589 aa  197  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 		 547 aa  197  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  30.21 
 
 		 459 aa  197  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 422 aa  196  9e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 470 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>