171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0316 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0316  carbohydrate kinase  100 
 
 
409 aa  822    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03341  carbohydrate kinase  84.11 
 
 
409 aa  705    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.913546  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03351  carbohydrate kinase  86.06 
 
 
409 aa  720    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.406346  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22191  carbohydrate kinase, FGGY family protein  47.92 
 
 
427 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0465  carbohydrate kinase  48.74 
 
 
412 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03441  carbohydrate kinase  51.62 
 
 
414 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.612767  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1686  sugar kinase  49.62 
 
 
411 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03991  carbohydrate kinase  49.01 
 
 
411 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.14778 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1870  carbohydrate kinase FGGY family  47.62 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5151  carbohydrate kinase FGGY  36.99 
 
 
431 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.68115e-16 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4096  carbohydrate kinase  36.94 
 
 
416 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.70469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1579  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.3 
 
 
432 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2006  carbohydrate kinase, FGGY  36.04 
 
 
413 aa  246  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301028  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2462  sugar kinase  35.47 
 
 
426 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.277689  hitchhiker  0.00000000000164105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0974  carbohydrate kinase, FGGY  35.7 
 
 
433 aa  238  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0442586  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2638  carbohydrate kinase FGGY  37.03 
 
 
417 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0870  carbohydrate kinase FGGY  35.46 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.781691  decreased coverage  0.000000974771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2564  carbohydrate kinase, FGGY  33.99 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0926  carbohydrate kinase, FGGY  33.09 
 
 
424 aa  232  8.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  32.78 
 
 
426 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3465  carbohydrate kinase FGGY  35.93 
 
 
417 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3223  putative carbohydrate kinase  31.97 
 
 
424 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2028  carbohydrate kinase FGGY  32.62 
 
 
432 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1226  FGGY family sugar kinase  34.22 
 
 
422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.806578  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2154  carbohydrate kinase FGGY  32.91 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.126362  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2020  carbohydrate kinase, FGGY  31.9 
 
 
476 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1396  carbohydrate kinase, FGGY  32.46 
 
 
425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0326227 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1241  carbohydrate kinase, FGGY  32.32 
 
 
435 aa  200  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000316835  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2187  carbohydrate kinase FGGY  29.83 
 
 
424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33450  predicted protein  31.83 
 
 
500 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38341  predicted protein  29.07 
 
 
442 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.435151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13290  pentulose/hexulose kinase  29.01 
 
 
496 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  27.27 
 
 
484 aa  136  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8238  carbohydrate kinase, FGGY  25.87 
 
 
492 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.758383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3132  carbohydrate kinase FGGY  26.85 
 
 
485 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2493  carbohydrate kinase FGGY  25.06 
 
 
474 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4080  carbohydrate kinase FGGY  24.59 
 
 
536 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128065  normal  0.790365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  21.09 
 
 
496 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  23.71 
 
 
510 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  23.39 
 
 
481 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  23.8 
 
 
496 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  25 
 
 
489 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  23.48 
 
 
484 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2839  xylulokinase  21.05 
 
 
478 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  23.98 
 
 
484 aa  63.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  22.43 
 
 
483 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1177  xylulose kinase  21.05 
 
 
478 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  23.58 
 
 
499 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2616  xylulokinase  20.37 
 
 
478 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3506  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.57 
 
 
509 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  22.57 
 
 
509 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  21.69 
 
 
482 aa  60.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  23.68 
 
 
499 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  21.11 
 
 
491 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  21.84 
 
 
498 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  23.92 
 
 
486 aa  59.7  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  25.52 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  23.85 
 
 
512 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  20.44 
 
 
508 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  22.03 
 
 
524 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  28.16 
 
 
511 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  23.78 
 
 
496 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  24.47 
 
 
502 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  26.72 
 
 
501 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  23.53 
 
 
518 aa  56.6  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  23.23 
 
 
494 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  22.14 
 
 
483 aa  57  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0756  xylulokinase  19.71 
 
 
479 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  24.03 
 
 
496 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  21.08 
 
 
517 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  20.85 
 
 
517 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  22.12 
 
 
489 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  23.13 
 
 
496 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  20.91 
 
 
511 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  21.9 
 
 
512 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  21.4 
 
 
510 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  22.97 
 
 
484 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  23.46 
 
 
485 aa  53.5  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  23.01 
 
 
498 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  21.54 
 
 
506 aa  53.1  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  23.3 
 
 
509 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  22.07 
 
 
505 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  21.65 
 
 
497 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  20 
 
 
489 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  25 
 
 
500 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  26.34 
 
 
496 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  22.51 
 
 
519 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  26.46 
 
 
509 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  22.57 
 
 
483 aa  50.4  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  22.41 
 
 
486 aa  50.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  19.91 
 
 
508 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  22.57 
 
 
483 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  22.69 
 
 
499 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  21.81 
 
 
502 aa  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  22.75 
 
 
484 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  22.32 
 
 
503 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  22.69 
 
 
498 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  21.17 
 
 
483 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.11 
 
 
492 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.11 
 
 
492 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>