More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35939 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_35939  predicted protein  100 
 
 
269 aa  538  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
270 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.309971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3329  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.58 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  37.26 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.47 
 
 
256 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
253 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
252 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0538  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.21 
 
 
265 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
258 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 
255 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
254 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
258 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0577833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
251 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
250 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 
253 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
247 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
247 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  33.72 
 
 
255 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  32.83 
 
 
253 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
258 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
251 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
250 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
250 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
246 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
248 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
246 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
253 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  32.45 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
248 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1003  glucose-1-dehydrogenase  30.74 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 
251 aa  99  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.18 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 
268 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
243 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0160173  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
261 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 
261 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
256 aa  99  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
282 aa  99  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.73 
 
 
246 aa  98.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1663  glucose-1-dehydrogenase  29.57 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2275  glucose-1-dehydrogenase  29.57 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5602  glucose-1-dehydrogenase  31.75 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0429275  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2313  glucose-1-dehydrogenase  29.96 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0520  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.35 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4147  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  32.35 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.180269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2191  glucose-1-dehydrogenase  29.53 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
249 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  31.27 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
252 aa  96.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
282 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2039  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
247 aa  95.9  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 
252 aa  95.5  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.77 
 
 
259 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 
251 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2298  glucose-1-dehydrogenase  29.18 
 
 
253 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.521278  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.5 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
247 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 
253 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0751  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 
250 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450614  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
269 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
281 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
256 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.7 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.85 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  32.03 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4559  Dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)-like protein  36.82 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  normal  0.0433101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 
263 aa  92.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>