More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0094 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  100 
 
 
501 aa  1029  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.95 
 
 
491 aa  112  1e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  27.42 
 
 
431 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.68 
 
 
441 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 
471 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  26.61 
 
 
431 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 
419 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
444 aa  89.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  23.06 
 
 
488 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 
451 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  27.57 
 
 
448 aa  88.2  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  22.85 
 
 
455 aa  87.8  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  26.26 
 
 
442 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 
433 aa  87.8  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.43 
 
 
435 aa  87.4  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 
473 aa  84.7  3e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 
489 aa  85.1  3e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
489 aa  84.7  4e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 
489 aa  84.3  4e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 
473 aa  84.3  4e-15  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 
489 aa  84.3  4e-15  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 
489 aa  84.7  4e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 
493 aa  84.3  4e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  4.40013e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 
473 aa  84.3  5e-15  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  27.76 
 
 
419 aa  84  5e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.55286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 
456 aa  82.8  1e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 
463 aa  82.8  1e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  21.46 
 
 
455 aa  82.4  2e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25.61 
 
 
446 aa  81.6  3e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 
439 aa  80.1  9e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  22.74 
 
 
470 aa  79.7  1e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 
461 aa  78.6  2e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 
470 aa  77.8  4e-13  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.61 
 
 
483 aa  77.8  4e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16260  Type I secretion outer membrane protein  24.93 
 
 
472 aa  77.4  6e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  25.84 
 
 
493 aa  77  8e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 
419 aa  76.6  9e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 
420 aa  76.6  9e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 
421 aa  76.6  9e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  25.21 
 
 
447 aa  76.3  1e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 
447 aa  76.3  1e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  27.69 
 
 
447 aa  76.6  1e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 
458 aa  76.3  1e-12  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 
418 aa  75.5  2e-12  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.31453e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  20.7 
 
 
463 aa  75.9  2e-12  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 
1496 aa  75.9  2e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 
426 aa  75.9  2e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 
457 aa  75.1  3e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 
477 aa  73.6  7e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 
451 aa  73.6  7e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 
469 aa  73.6  9e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  22.01 
 
 
503 aa  72.8  1e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 
482 aa  72.8  1e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  21.84 
 
 
476 aa  72.4  2e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  5.12131e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 
421 aa  72  2e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  24.13 
 
 
444 aa  72  2e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 
446 aa  72  2e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  20.39 
 
 
427 aa  72.4  2e-11  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 
462 aa  72  2e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 
442 aa  71.6  3e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 
449 aa  71.6  3e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 
465 aa  71.6  3e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.87559e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6215  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 
493 aa  70.9  6e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.811282  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.66 
 
 
497 aa  70.1  8e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.67 
 
 
469 aa  69.7  1e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 
635 aa  69.3  1e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  20.83 
 
 
443 aa  69.7  1e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  5.33026e-06  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  20.35 
 
 
451 aa  69.3  2e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  25.09 
 
 
731 aa  69.3  2e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 
435 aa  68.9  2e-10  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 
463 aa  68.9  2e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 
627 aa  68.6  3e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 
419 aa  68.2  3e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 
435 aa  68.2  4e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 
471 aa  67.8  4e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 
460 aa  67.4  5e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  22.09 
 
 
441 aa  67.8  5e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  26.07 
 
 
437 aa  67.4  6e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
444 aa  67  7e-10  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  21.81 
 
 
576 aa  67  7e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 
472 aa  67  7e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 
458 aa  66.6  9e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  23.27 
 
 
517 aa  66.6  9e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  24.74 
 
 
442 aa  66.6  9e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.01167e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 
463 aa  66.2  1e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.76 
 
 
437 aa  66.6  1e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  21.9 
 
 
463 aa  66.6  1e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 
565 aa  65.9  2e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 
464 aa  65.5  2e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 
467 aa  65.5  2e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.37 
 
 
515 aa  65.1  3e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 
423 aa  64.7  3e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  21.01 
 
 
473 aa  64.3  5e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 
535 aa  64.3  5e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 
762 aa  63.9  6e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.45 
 
 
450 aa  63.9  6e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.37 
 
 
446 aa  63.5  8e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  1.51154e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.29 
 
 
456 aa  63.5  8e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  19.23 
 
 
438 aa  63.5  9e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>