More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1649 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 584 aa  1197    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  70.21 
 
 		 607 aa  873    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  60.69 
 
 		 594 aa  746    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  62.35 
 
 		 595 aa  737    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  57.26 
 
 		 587 aa  698    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  70.55 
 
 		 607 aa  876    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  53.3 
 
 		 591 aa  619  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  51.37 
 
 		 587 aa  608  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  39.44 
 
 		 578 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  39.12 
 
 		 580 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  37.91 
 
 		 579 aa  345  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  37.73 
 
 		 579 aa  345  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  37.64 
 
 		 581 aa  335  1e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  32.38 
 
 		 577 aa  264  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  31.26 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  31.38 
 
 		 577 aa  251  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 		 578 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 		 638 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  29.2 
 
 		 573 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 584 aa  209  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 		 589 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  27.15 
 
 		 589 aa  207  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.14 
 
 		 540 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.88 
 
 		 538 aa  200  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 565 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 538 aa  194  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.01 
 
 		 546 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 534 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 622 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 539 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 576 aa  178  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 551 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 618 aa  166  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 619 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  26.13 
 
 		 557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 544 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  26.71 
 
 		 563 aa  160  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.89 
 
 		 544 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  25.04 
 
 		 529 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 536 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 		 529 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 529 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.88 
 
 		 539 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  26.01 
 
 		 515 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 524 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 655 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 512 aa  144  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 664 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  28.03 
 
 		 516 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 658 aa  141  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.31 
 
 		 505 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  27.7 
 
 		 579 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  27.7 
 
 		 580 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 		 645 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 658 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  26.75 
 
 		 545 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 541 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 567 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 657 aa  139  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 544 aa  138  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.23 
 
 		 594 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.86 
 
 		 556 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 534 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  24.56 
 
 		 531 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.92 
 
 		 522 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 510 aa  137  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 657 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.18 
 
 		 528 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.18 
 
 		 528 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.87 
 
 		 511 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 535 aa  137  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 655 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.08 
 
 		 509 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 765 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 535 aa  136  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 682 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.44 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  27.82 
 
 		 651 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  24.39 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.9 
 
 		 567 aa  135  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.35 
 
 		 596 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.220703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 547 aa  135  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 645 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 631 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 527 aa  134  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 541 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>