More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_10221 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  83.09 
 
 		 677 aa  1156    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09401  DNA primase  55.04 
 
 		 625 aa  707    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029627  normal  0.0569121 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  56.12 
 
 		 675 aa  786    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  56.55 
 
 		 686 aa  825    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  55.1 
 
 		 682 aa  820    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  82.94 
 
 		 677 aa  1158    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  46.73 
 
 		 694 aa  679    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  100 
 
 		 678 aa  1379    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  55.6 
 
 		 684 aa  836    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  82.94 
 
 		 677 aa  1157    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  57.16 
 
 		 679 aa  811    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  42.12 
 
 		 690 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  40.9 
 
 		 640 aa  480  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  45.75 
 
 		 636 aa  479  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  43.68 
 
 		 646 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  43.68 
 
 		 646 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  44.57 
 
 		 634 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  42.94 
 
 		 675 aa  453  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.15 
 
 		 599 aa  299  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.38 
 
 		 613 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.73 
 
 		 600 aa  282  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 604 aa  281  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  35.19 
 
 		 626 aa  280  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  35.02 
 
 		 613 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  32.92 
 
 		 601 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  38.46 
 
 		 595 aa  276  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  36.56 
 
 		 604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.44 
 
 		 663 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  36.43 
 
 		 656 aa  274  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  36.6 
 
 		 655 aa  273  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  36.97 
 
 		 664 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  35.95 
 
 		 638 aa  272  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  35.73 
 
 		 605 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  35.87 
 
 		 651 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  35.87 
 
 		 652 aa  267  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.08 
 
 		 601 aa  267  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  35.85 
 
 		 633 aa  266  7e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  35.89 
 
 		 663 aa  266  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  39.53 
 
 		 595 aa  266  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  31.84 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  39.53 
 
 		 595 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  35.92 
 
 		 660 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  35.92 
 
 		 660 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  31.91 
 
 		 598 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  31.91 
 
 		 598 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  31.91 
 
 		 598 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  31.91 
 
 		 598 aa  263  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  31.91 
 
 		 598 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  34.52 
 
 		 636 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  31.91 
 
 		 598 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  33.72 
 
 		 660 aa  263  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  35.83 
 
 		 632 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  33.64 
 
 		 617 aa  262  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  33.72 
 
 		 660 aa  262  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  32.45 
 
 		 599 aa  261  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  35.68 
 
 		 660 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  33.57 
 
 		 588 aa  261  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  33.03 
 
 		 617 aa  261  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  34.25 
 
 		 574 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  31.53 
 
 		 598 aa  260  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.27 
 
 		 592 aa  259  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  35.44 
 
 		 660 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  31.6 
 
 		 600 aa  259  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  37.91 
 
 		 553 aa  259  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  31.49 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  32.55 
 
 		 676 aa  259  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  36.53 
 
 		 666 aa  259  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  31.57 
 
 		 621 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  37.91 
 
 		 572 aa  258  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  30.86 
 
 		 652 aa  258  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  32.69 
 
 		 655 aa  258  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  33.33 
 
 		 645 aa  258  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  35.73 
 
 		 631 aa  258  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  35.73 
 
 		 614 aa  258  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  33.57 
 
 		 614 aa  256  9e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  32.03 
 
 		 583 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  33.88 
 
 		 590 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  33.88 
 
 		 590 aa  254  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  34.27 
 
 		 582 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  33.56 
 
 		 623 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  33.64 
 
 		 622 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  35.11 
 
 		 674 aa  253  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  31.73 
 
 		 598 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  32.29 
 
 		 601 aa  253  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  33.03 
 
 		 598 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  33.26 
 
 		 585 aa  251  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  33.89 
 
 		 571 aa  251  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  34.65 
 
 		 606 aa  251  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  33.72 
 
 		 588 aa  250  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  32.72 
 
 		 632 aa  250  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  33.49 
 
 		 652 aa  250  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  33.1 
 
 		 587 aa  250  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  33.88 
 
 		 631 aa  250  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  33.8 
 
 		 584 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  33.73 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  33.73 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  33.25 
 
 		 677 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  33.73 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  34.72 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  32.91 
 
 		 673 aa  248  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>