More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_05691 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  100 
 
 
338 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  76.58 
 
 
334 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  75.75 
 
 
333 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  74.85 
 
 
333 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  52.01 
 
 
335 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  52.01 
 
 
335 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  51.49 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  47.69 
 
 
342 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  47.06 
 
 
338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  45.76 
 
 
337 aa  312  5.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  41.32 
 
 
407 aa  301  9e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  45.6 
 
 
329 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  42.77 
 
 
331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  41.32 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  41.32 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 
337 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  39.5 
 
 
328 aa  278  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  39.08 
 
 
333 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  40 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  38.82 
 
 
333 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  40.31 
 
 
335 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  40.06 
 
 
330 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  40.68 
 
 
330 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  39.08 
 
 
333 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  37.35 
 
 
337 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  38.02 
 
 
337 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  38.63 
 
 
333 aa  263  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  38.32 
 
 
333 aa  263  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  37.92 
 
 
331 aa  262  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  38.49 
 
 
332 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  38.55 
 
 
337 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  38.55 
 
 
337 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  36.65 
 
 
338 aa  259  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  40.49 
 
 
333 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  37.89 
 
 
330 aa  258  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  37.23 
 
 
333 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  38.27 
 
 
331 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  37.58 
 
 
330 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  37.35 
 
 
338 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  41.53 
 
 
330 aa  256  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  37.58 
 
 
330 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  37.15 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  35.89 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  37.15 
 
 
331 aa  233  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  35.78 
 
 
330 aa  233  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  34.76 
 
 
330 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  35.62 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 
330 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  34.15 
 
 
330 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  35.9 
 
 
328 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  33.54 
 
 
336 aa  205  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  34.94 
 
 
335 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 
330 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 
333 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  33.64 
 
 
327 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  33.64 
 
 
327 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  32.81 
 
 
328 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  32.61 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  31.78 
 
 
339 aa  182  7e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  30.84 
 
 
339 aa  176  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  32.38 
 
 
331 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  30.43 
 
 
370 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  27.71 
 
 
360 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  26.92 
 
 
334 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.37 
 
 
317 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  25.55 
 
 
303 aa  99.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  24.55 
 
 
297 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  28.68 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  25.61 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50659  predicted protein  23.89 
 
 
347 aa  93.6  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  25.61 
 
 
304 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  26.2 
 
 
316 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  23.95 
 
 
315 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  27.07 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  26.64 
 
 
273 aa  89.4  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  23.81 
 
 
310 aa  89  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  27.59 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  26.1 
 
 
317 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  21.99 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  26.36 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_51242  predicted protein  26.28 
 
 
342 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215587  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  25.57 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  23.27 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.48 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  25.74 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  26.69 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  26.19 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  26.97 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  24.47 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  25.56 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  24.82 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  23.24 
 
 
332 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  26.38 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  25.17 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.79 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  23.74 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.68 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.74 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  26.39 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>