100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_15781 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_15781  STAS domain-containing protein  100 
 
 		 118 aa  236  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1153  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  77.97 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06941  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  73.04 
 
 		 115 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00555121  normal  0.159245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  72.03 
 
 		 128 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09291  STAS domain-containing protein  66.67 
 
 		 99 aa  143  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0243906 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0260  anti-anti-sigma regulatory factor  65.66 
 
 		 99 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2121  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  51.33 
 
 		 130 aa  103  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  47.83 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  47.32 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  47.37 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  46.43 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  46.43 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2283  anti-sigma-factor antagonist  46.74 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2311  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  57.58 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.61 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3879  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.337917 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  31 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4938  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  32.31 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  27.73 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0312  hypothetical protein, putative anti-sigma factor antagonist  28.57 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  29.41 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  36.76 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3105  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003528  anti-anti-sigma regulatory factor  35.14 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0047  anti-sigma-factor antagonist  37.93 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  30.95 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  41.07 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  31.88 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1812  hypothetical protein  58.97 
 
 		 41 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  30.34 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12900  anti-anti-sigma factor  33.75 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1066  anti sigma b factor antagonist RsbV  30.43 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8531e-37 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 436 aa  43.5  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  30.12 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0901  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  36.23 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  26.21 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  32.88 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.57 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1311  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  28.57 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  28.57 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  22.02 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3853  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  27.37 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  27.37 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6796  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  27.73 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  30.38 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  30.38 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  30.1 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  32.1 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1183  anti-sigma-factor antagonist  33.87 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  31.43 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10331  hypothetical protein  61.76 
 
 		 35 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.639916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  30.43 
 
 		 112 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 114 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.67 
 
 		 113 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2023  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.861552  normal  0.437325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2021  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  40.35 
 
 		 846 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5157  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5538  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02233  hypothetical protein  32.88 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5246  anti-sigma-factor antagonist  29.25 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  30 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  29.11 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3705  anti-sigma-factor antagonist  27.03 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0534968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 		 118 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  26.36 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  39.29 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  31.46 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1031  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.35 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1299  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0217116  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1282  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  21.5 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  31.08 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  30.3 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  31.51 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  27.47 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  25.64 
 
 		 109 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>