More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1963 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  39.26 
 
 
7210 aa  786    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  37.72 
 
 
1584 aa  730    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  40.96 
 
 
3463 aa  758    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  37.46 
 
 
1955 aa  781    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  43.13 
 
 
1349 aa  756    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  43.91 
 
 
6889 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  39.33 
 
 
3033 aa  793    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.89 
 
 
2136 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  40.33 
 
 
1593 aa  736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  43.69 
 
 
2232 aa  691    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  40.53 
 
 
4882 aa  798    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  40.29 
 
 
3930 aa  752    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  37.65 
 
 
3281 aa  691    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  40.57 
 
 
6768 aa  760    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.21 
 
 
1372 aa  757    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.92 
 
 
2551 aa  835    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 
1874 aa  806    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  47.97 
 
 
1656 aa  853    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  44.17 
 
 
1144 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  48.23 
 
 
1587 aa  835    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  41.81 
 
 
5154 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  43.65 
 
 
3099 aa  733    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  40.2 
 
 
1548 aa  803    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2880 aa  5663    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  36.76 
 
 
2024 aa  721    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  40.69 
 
 
3252 aa  695    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.13 
 
 
1349 aa  756    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  39.96 
 
 
5255 aa  751    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  43.92 
 
 
1087 aa  810    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  42.58 
 
 
3337 aa  690    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  37.68 
 
 
4111 aa  663    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  39.29 
 
 
3424 aa  707    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  38.21 
 
 
3449 aa  744    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  37.17 
 
 
4165 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  41.23 
 
 
2462 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  39.79 
 
 
3711 aa  754    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  35.08 
 
 
4264 aa  770    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  40.07 
 
 
1208 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  41.61 
 
 
3693 aa  936    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.64 
 
 
1101 aa  657    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  35.64 
 
 
1520 aa  693    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  41.72 
 
 
4575 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  35.63 
 
 
1580 aa  718    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  42.17 
 
 
3130 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  41.83 
 
 
3427 aa  861    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  45.33 
 
 
3254 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  37.83 
 
 
2551 aa  657    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  44.32 
 
 
1354 aa  775    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  39.28 
 
 
2975 aa  802    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  42.86 
 
 
2376 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
3092 aa  842    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  41.11 
 
 
4080 aa  783    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.43 
 
 
2762 aa  984    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.68 
 
 
1559 aa  966    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.89 
 
 
4478 aa  972    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  36.64 
 
 
1537 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  46.49 
 
 
1337 aa  788    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  39.8 
 
 
4840 aa  711    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  41.61 
 
 
3693 aa  936    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  35.64 
 
 
1520 aa  693    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 
5400 aa  794    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  35.63 
 
 
1580 aa  718    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  41.34 
 
 
2333 aa  675    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  39.42 
 
 
3158 aa  774    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  43.34 
 
 
3676 aa  918    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  47.5 
 
 
2477 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  43.46 
 
 
3696 aa  945    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  40.39 
 
 
4151 aa  818    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  35.86 
 
 
1573 aa  667    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  40.56 
 
 
4183 aa  754    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  37.11 
 
 
1581 aa  776    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
7110 aa  781    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  42.01 
 
 
3645 aa  884    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.23 
 
 
1909 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  38.14 
 
 
4930 aa  688    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  41.64 
 
 
1939 aa  706    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  39 
 
 
7279 aa  963    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
3874 aa  678    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  45.32 
 
 
2230 aa  684    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  41.28 
 
 
3702 aa  927    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
1816 aa  660    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  35.51 
 
 
1580 aa  715    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  41.97 
 
 
2374 aa  664    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  40.69 
 
 
3494 aa  761    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  44.16 
 
 
3176 aa  949    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  42.15 
 
 
3679 aa  921    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  39.63 
 
 
3493 aa  741    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  43.35 
 
 
2890 aa  681    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  43.57 
 
 
3670 aa  734    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  37.36 
 
 
1822 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  36.64 
 
 
1577 aa  771    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.87 
 
 
1559 aa  962    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  37.87 
 
 
3508 aa  635  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  44.96 
 
 
1602 aa  635  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  49.4 
 
 
2103 aa  633  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.52 
 
 
1804 aa  630  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  43.29 
 
 
2985 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  42.24 
 
 
2047 aa  629  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  39.14 
 
 
1909 aa  624  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  40.18 
 
 
1402 aa  620  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>