244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NmulC_2795 on replicon NC_007616
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007616  NmulC_2795  resolvase family site-specific recombinase  100 
 
 		 81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.127054  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  87.67 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  52.7 
 
 		 188 aa  73.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  51.35 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  52.05 
 
 		 203 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  46.75 
 
 		 194 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  50.68 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  51.35 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  45.21 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  43.84 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  45.95 
 
 		 219 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  46.58 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  44.59 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  44.59 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  39.73 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  47.37 
 
 		 463 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  39.73 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  40 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  46.38 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  40.79 
 
 		 181 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2979  resolvase domain-containing protein  36.49 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4731  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 187 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3256  Fis family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0578977  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  43.24 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  38.96 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3338  resolvase domain-containing protein  45.07 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  38.46 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  45.21 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  38.96 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  43.66 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  43.59 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  39.73 
 
 		 186 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  42.67 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40.26 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  39.19 
 
 		 194 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  39.73 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  39.19 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  43.66 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  38.96 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  52.94 
 
 		 184 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  43.48 
 
 		 204 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  52 
 
 		 197 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  38.16 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 189 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  38.46 
 
 		 201 aa  50.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0026c  DNA integration/recombination/inversion protein  59.52 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  53.66 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0053  hypothetical protein  35.62 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  41.56 
 
 		 193 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  41.56 
 
 		 309 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  40.26 
 
 		 188 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  40.79 
 
 		 198 aa  50.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  40.26 
 
 		 186 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  40.26 
 
 		 186 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  40.26 
 
 		 186 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  40.26 
 
 		 186 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  40.26 
 
 		 186 aa  50.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  50.98 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  38.16 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  39.44 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  41.56 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  45.07 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  35.62 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  39.19 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  40.79 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  40.79 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  40.58 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  38.96 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  40.79 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  35.06 
 
 		 209 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  38.96 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1209  putative resolvase  40.58 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  40.58 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  40.58 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  40.58 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  36.99 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  37.66 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  42.03 
 
 		 228 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  38.96 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  40.79 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  40.79 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  51.16 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  41.77 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  40.79 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0002  DNA-invertase, C-terminal region  39.73 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  49.02 
 
 		 189 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.49 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  42.86 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  61.76 
 
 		 310 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  41.18 
 
 		 204 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  41.18 
 
 		 204 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  53.42 
 
 		 189 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  35.21 
 
 		 192 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  64.71 
 
 		 309 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  35.21 
 
 		 192 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  32.91 
 
 		 169 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  36.84 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>