More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0256 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  100 
 
 		 288 aa  593  1e-168  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  47.22 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  46.45 
 
 		 289 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  45.36 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  43.73 
 
 		 289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  43.06 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  42.65 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  40.74 
 
 		 299 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  41.49 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40.93 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  38.49 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.86 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2934  putative methylisocitrate lyase  36.62 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  38.68 
 
 		 289 aa  222  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  40.07 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  39.43 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  39.64 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  37.54 
 
 		 292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  38.52 
 
 		 287 aa  218  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  40.56 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  38.38 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  37.46 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  42.74 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  38.43 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  38.08 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  38.43 
 
 		 286 aa  215  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  43.81 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  36.33 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0283  putative methylisocitrate lyase  43.68 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.548186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  36.69 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  39.07 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  35.11 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  39.07 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  38.71 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  37.14 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  37.28 
 
 		 284 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  36.88 
 
 		 295 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0461  2,3-dimethylmalate lyase  38.55 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  36.92 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  35.54 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  37.41 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  36.92 
 
 		 284 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  39.35 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  38.99 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  37.98 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  38.99 
 
 		 302 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  36.24 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.99 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.99 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2775  2,3-dimethylmalate lyase  37.72 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  35.84 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  38.99 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  38.99 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  36.56 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  38.58 
 
 		 274 aa  206  5e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  37.55 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.99 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  36.76 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.99 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.63 
 
 		 302 aa  205  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  36.43 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0458  2,3-dimethylmalate lyase  37.54 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  37.91 
 
 		 302 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  37.05 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  37.05 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  36.23 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  37.11 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  36.2 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  37.5 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  37.05 
 
 		 294 aa  199  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  38.25 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  36.19 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  37.72 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09369  conserved hypothetical protein  38.13 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.925933  hitchhiker  0.00486144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  39.52 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  39.52 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  39.52 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1177  2-methylisocitrate lyase  37.68 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.984478  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0819  2-methylisocitrate lyase  37.68 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445655  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  39.52 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  38.25 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  39.52 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  39.2 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2421  2-methylisocitrate lyase  37.87 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  38.71 
 
 		 292 aa  195  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  38.71 
 
 		 292 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  38.71 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  38.71 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  38.49 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23210  2-methylisocitrate lyase  38.89 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  38.1 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1122  2-methylisocitrate lyase  36.07 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18345  predicted protein  37.54 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1935  2-methylisocitrate lyase  38.49 
 
 		 294 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146073  hitchhiker  0.00000021306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  38.1 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  36.69 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  35.97 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  38.15 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1509  2-methylisocitrate lyase  35.59 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  38 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>