81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0064 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 168 aa  337  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  56.44 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  55.28 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  51.53 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  52.8 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  57.86 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  52.47 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 		 163 aa  147  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  52.66 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  49.1 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  51.53 
 
 		 155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  47.93 
 
 		 155 aa  143  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  50.93 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  49.39 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  56.06 
 
 		 155 aa  131  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  55.15 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  50.92 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  44.38 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 324 aa  123  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  41.57 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  47.53 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1047  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 324 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 221 aa  44.7  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 289 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  34.51 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 296 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  31.06 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  31.06 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  32.43 
 
 		 157 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  32.14 
 
 		 158 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35.44 
 
 		 301 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  32.43 
 
 		 160 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  32.43 
 
 		 160 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03710  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.54 
 
 		 162 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.626729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 153 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  32.43 
 
 		 160 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 		 221 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 240 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  49.12 
 
 		 473 aa  41.2  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 239 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  42.11 
 
 		 211 aa  41.6  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 239 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 136 aa  41.2  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9419  hypothetical protein  57.58 
 
 		 361 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 193 aa  40.8  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 173 aa  40.8  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 172 aa  40.8  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 132 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.25 
 
 		 178 aa  40.8  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.25 
 
 		 176 aa  40.8  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>