69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1413 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  44.51 
 
 		 1047 aa  669    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  44.26 
 
 		 1040 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  50.79 
 
 		 1076 aa  966    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  44.94 
 
 		 1045 aa  672    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 		 1043 aa  2028    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  44.45 
 
 		 1047 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  44.47 
 
 		 1037 aa  643    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  43.84 
 
 		 1054 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  39.06 
 
 		 1049 aa  596  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  40.55 
 
 		 1048 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  39.76 
 
 		 1049 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  39.72 
 
 		 1049 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  38.72 
 
 		 1048 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  40.19 
 
 		 1042 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  38.48 
 
 		 1053 aa  567  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  39.37 
 
 		 1052 aa  565  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  39.28 
 
 		 1052 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  41.69 
 
 		 1015 aa  552  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  39.96 
 
 		 1042 aa  551  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  38.74 
 
 		 1052 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  38.61 
 
 		 1001 aa  542  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  37.04 
 
 		 1059 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  36.3 
 
 		 1064 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  34.02 
 
 		 1047 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  36.18 
 
 		 1064 aa  503  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  37.46 
 
 		 999 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  35.66 
 
 		 1062 aa  479  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  38.39 
 
 		 1018 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  34.27 
 
 		 991 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  35.55 
 
 		 1014 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1016 aa  372  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  33.62 
 
 		 997 aa  349  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  33.43 
 
 		 997 aa  347  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  33.08 
 
 		 1000 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  34.4 
 
 		 991 aa  341  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  31.71 
 
 		 977 aa  337  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  32.15 
 
 		 986 aa  333  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  30.53 
 
 		 993 aa  294  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  33.76 
 
 		 959 aa  280  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  32.5 
 
 		 980 aa  263  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  32.4 
 
 		 988 aa  203  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  20.31 
 
 		 911 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  19.74 
 
 		 914 aa  128  6e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  22.74 
 
 		 890 aa  125  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  27.81 
 
 		 976 aa  92.8  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.36 
 
 		 958 aa  90.9  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  47.31 
 
 		 142 aa  80.1  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  26.77 
 
 		 962 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  28.21 
 
 		 779 aa  73.9  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  26.14 
 
 		 947 aa  67  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  24.42 
 
 		 951 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.09 
 
 		 836 aa  61.6  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  27.78 
 
 		 990 aa  56.6  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1692  hypothetical protein  26.06 
 
 		 972 aa  53.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  29.55 
 
 		 846 aa  53.5  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  24.12 
 
 		 994 aa  52.4  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  22.55 
 
 		 872 aa  50.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  20.42 
 
 		 909 aa  51.2  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  20.12 
 
 		 919 aa  48.5  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  33.58 
 
 		 278 aa  47.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  24.88 
 
 		 1106 aa  46.6  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  26.96 
 
 		 856 aa  47  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  27.07 
 
 		 883 aa  46.6  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  35.71 
 
 		 1055 aa  47  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  24.09 
 
 		 984 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.57 
 
 		 915 aa  46.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  19.16 
 
 		 968 aa  45.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  29.71 
 
 		 291 aa  44.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  22.07 
 
 		 862 aa  44.7  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>