More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1174 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
174 aa  338  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  9.20712e-09  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  82.76 
 
 
174 aa  285  3e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  1.837e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  53.85 
 
 
169 aa  149  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  46.21 
 
 
173 aa  116  1e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  37.93 
 
 
174 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  38.64 
 
 
176 aa  105  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.72992e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.36563e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  42.11 
 
 
172 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  39.6 
 
 
174 aa  94.4  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  40.27 
 
 
174 aa  94.4  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  34.66 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.57466e-09  unclonable  2.89216e-08 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  40.97 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 
175 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.04852e-06  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  36.87 
 
 
181 aa  92  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  40.58 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  38.06 
 
 
174 aa  90.9  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  39.58 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  38.93 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  3.83704e-08 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 
173 aa  89  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.71161e-05 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 
173 aa  89  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  35 
 
 
172 aa  89  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 
173 aa  89  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  40.13 
 
 
176 aa  88.2  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  39.85 
 
 
174 aa  87  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  35.76 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  36.2 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.12903e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  84.7  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  6.89021e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  32.74 
 
 
186 aa  84.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  36.14 
 
 
176 aa  84.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 
177 aa  84.3  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.59828e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  39.86 
 
 
173 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.67 
 
 
176 aa  83.6  1e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  38.31 
 
 
173 aa  83.6  1e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  42.06 
 
 
167 aa  83.6  1e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  37.31 
 
 
173 aa  83.6  1e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  37.43 
 
 
176 aa  83.2  2e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
187 aa  83.2  2e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  39.46 
 
 
173 aa  83.2  2e-15  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
166 aa  83.2  2e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  36.21 
 
 
190 aa  82.4  3e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
205 aa  82.4  3e-15  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  37.18 
 
 
168 aa  82  3e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  37.18 
 
 
168 aa  82  3e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  41.35 
 
 
174 aa  82.4  3e-15  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  36 
 
 
181 aa  82.4  3e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  6.65859e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  37.75 
 
 
178 aa  82  4e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  39.47 
 
 
173 aa  81.6  5e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  41.45 
 
 
172 aa  80.9  9e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  35.44 
 
 
168 aa  80.5  1e-14  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  38.1 
 
 
183 aa  80.5  1e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.54953e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  38.52 
 
 
166 aa  80.9  1e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  1.59716e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  38.52 
 
 
166 aa  80.9  1e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  3.32682e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  36.17 
 
 
189 aa  79.7  2e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  38.58 
 
 
174 aa  79.3  2e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  36.81 
 
 
173 aa  78.6  4e-14  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
166 aa  78.6  4e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  2.52117e-10  unclonable  5.89874e-26 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  35.9 
 
 
171 aa  78.6  4e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
166 aa  78.6  5e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  7.93252e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  37.33 
 
 
172 aa  78.2  5e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  33.93 
 
 
182 aa  78.2  5e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 
182 aa  78.2  5e-14  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 
179 aa  78.2  6e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  2.3806e-12 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  36 
 
 
172 aa  78.2  6e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
166 aa  77.8  7e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.24346e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
166 aa  77.8  7e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  4.77259e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  40.77 
 
 
166 aa  77.8  7e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.59135e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
166 aa  77.8  7e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  7.3314e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
166 aa  77.8  7e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.26178e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
166 aa  77.8  7e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
166 aa  77.8  7e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.38487e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
166 aa  77.8  7e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  7.18586e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
166 aa  77.8  7e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 
174 aa  77.4  8e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  33.79 
 
 
175 aa  77  1e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  36.6 
 
 
215 aa  77  1e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 
166 aa  77  1e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.79203e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  37.16 
 
 
172 aa  77  1e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 
166 aa  77  1e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  2.33555e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0256  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 
178 aa  77.4  1e-13  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  6.51654e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  30.59 
 
 
178 aa  77.4  1e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  35.9 
 
 
172 aa  77.4  1e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  37.16 
 
 
172 aa  77  1e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  41.18 
 
 
203 aa  77  1e-13  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
173 aa  77.4  1e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  36.67 
 
 
175 aa  76.6  2e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  34.42 
 
 
172 aa  76.6  2e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  35.51 
 
 
167 aa  76.3  2e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  36 
 
 
172 aa  76.6  2e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  37.84 
 
 
174 aa  76.6  2e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  35.51 
 
 
167 aa  76.3  2e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  6.43388e-07 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  32.57 
 
 
181 aa  76.3  2e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  8.17286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 
174 aa  75.5  3e-13  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 
172 aa  75.9  3e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
195 aa  75.5  3e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 
165 aa  75.1  4e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  33.96 
 
 
172 aa  75.5  4e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  34.78 
 
 
165 aa  75.5  4e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  32.53 
 
 
172 aa  74.7  6e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  35.03 
 
 
172 aa  74.7  6e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>