More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0256 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0256  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 178 aa  360  7.0000000000000005e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651654  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  35.47 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  37.29 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  35.23 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  35.67 
 
 		 176 aa  100  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  35.75 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  39.05 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36.16 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36.16 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  33.74 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  32.14 
 
 		 174 aa  94.7  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  31.18 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  32.35 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  32.5 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  32.75 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 190 aa  85.1  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  32.34 
 
 		 178 aa  85.1  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 167 aa  84.7  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  32.5 
 
 		 166 aa  84.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 175 aa  84.3  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  34.01 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  29.17 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  34.53 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  34.38 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  31.18 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  30.63 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  27.65 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  32.58 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  32.28 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  32.58 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  29.76 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  32.74 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  35.81 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  32.12 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  30.29 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  31.82 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  27.91 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  31.65 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  29.65 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  32.18 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  32.69 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  34.55 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  29.38 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  28.57 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  31.4 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  28.99 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  30.29 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  30.29 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  30.06 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  30.06 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  28.9 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  29.52 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  28.41 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  30.36 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0591  50S ribosomal protein L10  32.87 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00143535  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  30.3 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  30.3 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  27.85 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  28.86 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  27.22 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  32.12 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  32.12 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  32.12 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  28 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  31.25 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>