More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4774 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 266 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  54.17 
 
 		 267 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  55.23 
 
 		 264 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  44.96 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  40.18 
 
 		 449 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.86 
 
 		 309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.05 
 
 		 381 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  35.91 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 264 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.88 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  37.07 
 
 		 332 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 		 567 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  35.07 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  36.4 
 
 		 576 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.58 
 
 		 333 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 		 343 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  38.54 
 
 		 521 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  39.11 
 
 		 216 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 		 343 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 		 320 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  35.78 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  40.51 
 
 		 336 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  40.51 
 
 		 336 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.14 
 
 		 862 aa  92  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  39.42 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  36.53 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  37.88 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.32 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  38.19 
 
 		 294 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  37.91 
 
 		 517 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  37.66 
 
 		 441 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.79 
 
 		 745 aa  89.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  37.77 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 		 493 aa  89.7  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  38.02 
 
 		 234 aa  89  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  37.06 
 
 		 515 aa  89  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  37.18 
 
 		 493 aa  89  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.86 
 
 		 489 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  37.44 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  34.98 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  36.77 
 
 		 420 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  40.31 
 
 		 412 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  34.96 
 
 		 340 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 		 184 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  41.4 
 
 		 190 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  40.98 
 
 		 203 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  31.76 
 
 		 448 aa  86.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  36.97 
 
 		 278 aa  85.9  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  34.43 
 
 		 351 aa  85.9  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  37.98 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  36.74 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  36.51 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  35.68 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  37.31 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  34.45 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  31.12 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 		 880 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  33.01 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  33.9 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  40.78 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  40.78 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  31.44 
 
 		 600 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  35.54 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  34.54 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  29.26 
 
 		 440 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  34.44 
 
 		 880 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  33.97 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  36.46 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  35.78 
 
 		 389 aa  82  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  35.9 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  36.7 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  30.86 
 
 		 872 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  38.55 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  35.9 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  34.44 
 
 		 880 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  33.47 
 
 		 483 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  34.44 
 
 		 880 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  39.3 
 
 		 1033 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  34.44 
 
 		 880 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  34.44 
 
 		 877 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  33.19 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  37.04 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  36.07 
 
 		 401 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  36.7 
 
 		 447 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  34.33 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  34.29 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  34.27 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  34.2 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.02 
 
 		 525 aa  78.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  35.47 
 
 		 1191 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  28.38 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  34.95 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  38.97 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  34.25 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  29.26 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  34.95 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>