47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2660 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2660  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 		 402 aa  800    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000971768  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0429  phosphoesterase domain-containing protein  47.57 
 
 		 405 aa  343  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2236  phosphoesterase domain-containing protein  47.15 
 
 		 405 aa  334  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2510  phosphoesterase, RecJ-like  44.12 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0289  hypothetical protein  45.72 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2340  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.48 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0121  phosphoesterase domain-containing protein  33.65 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.21571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2111  hypothetical protein  33.09 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1505  phosphoesterase, RecJ-like protein  28.38 
 
 		 461 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.393895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1752  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.68 
 
 		 466 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000395998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  27.46 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1566  phosphoesterase domain-containing protein  25.86 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.49427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1701  phosphoesterase domain-containing protein  24.47 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00562883  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1060  phosphoesterase domain-containing protein  25.12 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0345  phosphoesterase domain-containing protein  24.32 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0931  phosphoesterase RecJ domain protein  36.99 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0139  phosphoesterase domain-containing protein  24.54 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0769359  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1509  phosphoesterase DHHA1  24.58 
 
 		 473 aa  94.7  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0271209 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2008  phosphoesterase RecJ domain protein  30.09 
 
 		 515 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.389083  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1116  phosphoesterase RecJ domain protein  23.28 
 
 		 477 aa  94.4  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000172525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2276  phosphoesterase, RecJ-like  26.42 
 
 		 468 aa  90.9  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1059  phosphoesterase RecJ domain protein  26.21 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228608  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2552  phosphoesterase DHHA1  34.36 
 
 		 473 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3679  phosphoesterase RecJ domain protein  25.59 
 
 		 500 aa  82.8  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1375  phosphoesterase RecJ domain protein  23.06 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0514  phosphoesterase domain-containing protein  23.52 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1347  hypothetical protein  24.6 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.207653  hitchhiker  0.000859058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1828  phosphoesterase domain-containing protein  27.35 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.901941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1684  phosphoesterase, DHHA1  28.03 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2532  phosphoesterase RecJ domain protein  26.6 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1344  phosphoesterase domain-containing protein  27.35 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.929702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1725  exonuclease RecJ  30.81 
 
 		 467 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0990  phosphoesterase domain-containing protein  29.86 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0955  phosphoesterase domain-containing protein  29.52 
 
 		 467 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0982  phosphoesterase domain-containing protein  28.23 
 
 		 467 aa  53.1  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.257055  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1214  phosphoesterase RecJ domain protein  27.76 
 
 		 545 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0990291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0860  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.22 
 
 		 644 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  30.11 
 
 		 566 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.73 
 
 		 566 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1057  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  28.1 
 
 		 574 aa  49.7  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2099  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.1 
 
 		 669 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.339725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.19 
 
 		 566 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1599  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.44 
 
 		 702 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.82 
 
 		 619 aa  47.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2554  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.81 
 
 		 723 aa  46.6  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.46 
 
 		 579 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.77 
 
 		 583 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>