More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1163 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  100 
 
 		 290 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  97.59 
 
 		 290 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0298  inner-membrane translocator  94.14 
 
 		 290 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.474045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  76.63 
 
 		 291 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  76.29 
 
 		 291 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4054  inner-membrane translocator  75.92 
 
 		 299 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  75.68 
 
 		 296 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000968352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  73.97 
 
 		 292 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3520  inner-membrane translocator  76.98 
 
 		 291 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0611  inner-membrane translocator  73.2 
 
 		 304 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2180  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  52.88 
 
 		 277 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1698  inner-membrane translocator  52.07 
 
 		 292 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0299512  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1769  inner-membrane translocator  51.72 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1683  inner-membrane translocator  45.99 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00416283  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0479  inner-membrane translocator  47.9 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 290 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 289 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.02 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4061  inner-membrane translocator  37.11 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 287 aa  158  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4852  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5339  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1967  inner-membrane translocator  36.97 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207347  normal  0.0517862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 287 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  34.69 
 
 		 290 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.77 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  34.51 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  34 
 
 		 295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.98 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.43 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 		 294 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.32 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.32 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.32 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.44 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.77 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.98 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.44 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  33 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 291 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.33 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  32.56 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.99 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 338 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.69 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>