60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0138 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 138 aa  272  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  73.08 
 
 		 135 aa  191  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  42.97 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  41.98 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  41.8 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  38.46 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  38.05 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  34.21 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  37.69 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  38.14 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  35.54 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  32.26 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  32.54 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  36.51 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  35.25 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  32.33 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  35.82 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  36.76 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  29.92 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  31.54 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  36.78 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  34.62 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  29.17 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  34.23 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2022  hypothetical protein  42.11 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  32.79 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  38.54 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  33.05 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  30.33 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  27.87 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  27.87 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  27.87 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  29.03 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  35.82 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  34.48 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  28.87 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  34.71 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  27.56 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  30.09 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  30.4 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  24.63 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  29.27 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  40.45 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2448  CopG domain protein DNA-binding domain protein  33.61 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  27.73 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  31.25 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  25.9 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  31.82 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  32.76 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  36.92 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3281  hypothetical protein  36.26 
 
 		 92 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>