More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4433 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  657    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  47.98 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0154  hypothetical protein  50.84 
 
 
326 aa  330  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0902  tricarboxylic transport  48.72 
 
 
325 aa  330  1e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.897753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  49.22 
 
 
323 aa  328  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  52.04 
 
 
329 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4393  hypothetical protein  51.49 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  49.24 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  51.16 
 
 
326 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  51.16 
 
 
326 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  50.5 
 
 
326 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3966  hypothetical protein  47.85 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.846302  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  47.55 
 
 
325 aa  318  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  47.85 
 
 
325 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  47.85 
 
 
325 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  47.85 
 
 
325 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  47.85 
 
 
325 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  47.85 
 
 
325 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4232  TctC protein, putative  49.17 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  47.48 
 
 
346 aa  311  6.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  48.84 
 
 
326 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49460  tripartite tricarboxylate transporter periplasmic receptor protein  49.83 
 
 
327 aa  308  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0378673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  48.17 
 
 
326 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  49.17 
 
 
327 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  47.04 
 
 
321 aa  298  7e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1452  hypothetical protein  43.56 
 
 
323 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3933  extra-cytoplasmic solute receptor  46.58 
 
 
311 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05850  hypothetical protein  41.1 
 
 
325 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49490  Uncharacterized protein family UPF0065  42.24 
 
 
325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00178438  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3804  hypothetical protein  41.89 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0115718  normal  0.430416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3334  hypothetical protein  42.54 
 
 
339 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  40.52 
 
 
322 aa  245  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  40.33 
 
 
321 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  38.7 
 
 
329 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  35.16 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  35.35 
 
 
330 aa  215  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3784  hypothetical protein  33.66 
 
 
327 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3856  hypothetical protein  32.93 
 
 
331 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000269594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  35.88 
 
 
325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  33.66 
 
 
346 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  30.46 
 
 
330 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  29.27 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  29.49 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  31.77 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  31.44 
 
 
314 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  31.1 
 
 
314 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  31.1 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  29.93 
 
 
319 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  32.19 
 
 
332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  31 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  32.73 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  29.73 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  29.79 
 
 
319 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  30.1 
 
 
313 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  29.97 
 
 
316 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  29.38 
 
 
323 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  28.81 
 
 
326 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  29.45 
 
 
319 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  29.45 
 
 
319 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  27.83 
 
 
314 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  29.66 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  29.49 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3123  hypothetical protein  29.34 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  27.84 
 
 
319 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  28.08 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  28.14 
 
 
319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  28.98 
 
 
321 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  30.28 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  28.96 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  27.63 
 
 
319 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  29.29 
 
 
328 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  29.73 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  27.09 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  29.69 
 
 
322 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  28.77 
 
 
322 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  30.03 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  26.76 
 
 
322 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  26.76 
 
 
322 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  27.7 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2732  hypothetical protein  31.4 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15224  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  29.11 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  26.53 
 
 
332 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  28.15 
 
 
332 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  28.09 
 
 
334 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  26.35 
 
 
328 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  28.91 
 
 
335 aa  106  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  27.33 
 
 
328 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  27.76 
 
 
322 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.73 
 
 
326 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  26.82 
 
 
336 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  27 
 
 
330 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  28.33 
 
 
323 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  28.71 
 
 
318 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  27 
 
 
328 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  27 
 
 
328 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  27.38 
 
 
324 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  27.7 
 
 
339 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  27.03 
 
 
308 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  33.95 
 
 
323 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.19179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 
324 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>