More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1250 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  94.36 
 
 
390 aa  733  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  80.51 
 
 
390 aa  665  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  93.08 
 
 
390 aa  724  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
390 aa  791  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  69.25 
 
 
391 aa  572  1e-162  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  38.94 
 
 
406 aa  267  3e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  39.65 
 
 
408 aa  266  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  38.64 
 
 
391 aa  253  4e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  42.05 
 
 
407 aa  244  2e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  37.75 
 
 
395 aa  243  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  38.87 
 
 
398 aa  229  8e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  37.91 
 
 
399 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  37.31 
 
 
397 aa  222  1e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  38.17 
 
 
402 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  37.16 
 
 
398 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  34.44 
 
 
399 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  36.76 
 
 
396 aa  209  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  32.96 
 
 
386 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 
387 aa  187  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  32.23 
 
 
396 aa  179  5e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  7.99674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  31.49 
 
 
392 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  31.77 
 
 
385 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  32.43 
 
 
391 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  32.6 
 
 
386 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 
392 aa  169  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  32.23 
 
 
396 aa  166  6e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  31.06 
 
 
385 aa  163  5e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  33.51 
 
 
402 aa  162  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  33.95 
 
 
416 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  31.39 
 
 
365 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
385 aa  156  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  32.03 
 
 
381 aa  139  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.52 
 
 
341 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.22 
 
 
378 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.19 
 
 
375 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 
384 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  30.62 
 
 
453 aa  119  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  28.33 
 
 
382 aa  117  2e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.33 
 
 
384 aa  118  2e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  29.65 
 
 
363 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 
360 aa  115  1e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  28.91 
 
 
379 aa  115  1e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  30.09 
 
 
348 aa  112  1e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 
413 aa  112  2e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0513  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
385 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 
376 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.46 
 
 
375 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 
421 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 
379 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 
389 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 
382 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 
380 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 
418 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 
380 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  28.5 
 
 
452 aa  100  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 
380 aa  99.8  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  27.45 
 
 
452 aa  99.8  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27 
 
 
418 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
410 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 
380 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  30 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.61 
 
 
446 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 
455 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.69 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  30 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 
424 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 
453 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.24 
 
 
398 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.61 
 
 
446 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 
370 aa  97.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 
425 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 
457 aa  96.3  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  28.15 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  6.08264e-05  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  30.07 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  29.49 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  28.15 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  30.07 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  7.12182e-10 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  26.41 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.41 
 
 
446 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 
385 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 
394 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 
380 aa  92.8  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 
431 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  26.43 
 
 
388 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 
423 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.09 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 
432 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 
458 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 
423 aa  90.1  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 
406 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  25.23 
 
 
379 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 
384 aa  89.7  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.05 
 
 
445 aa  89.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  30.58 
 
 
408 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0189229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>