More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2643 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  100 
 
 		 441 aa  915    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  41.07 
 
 		 450 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  42.92 
 
 		 469 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  41.89 
 
 		 451 aa  345  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 		 454 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  41.59 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.97 
 
 		 467 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  44.24 
 
 		 450 aa  342  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  42.73 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.53 
 
 		 456 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.69 
 
 		 470 aa  335  9e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 		 480 aa  333  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  43.47 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  39.78 
 
 		 449 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  41.12 
 
 		 449 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.78 
 
 		 454 aa  326  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  39.03 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  40.4 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  40.4 
 
 		 444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  38.65 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.92 
 
 		 490 aa  316  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.4 
 
 		 451 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2569  coproporphyrinogen III oxidase  41.26 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  41.53 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  41.53 
 
 		 450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 		 444 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 458 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 		 463 aa  299  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  35.12 
 
 		 451 aa  299  7e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  37.07 
 
 		 463 aa  297  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  33.86 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1668  coproporphyrinogen III oxidase  40.87 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  37.41 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  36.82 
 
 		 494 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  33.63 
 
 		 451 aa  293  5e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  36.24 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  34.52 
 
 		 451 aa  290  3e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  36.07 
 
 		 457 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0233  coproporphyrinogen III oxidase  35.96 
 
 		 457 aa  290  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.891625  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  35.27 
 
 		 453 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  34.83 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  38.92 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  35.33 
 
 		 472 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  36.14 
 
 		 494 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.52 
 
 		 465 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.52 
 
 		 465 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  35.03 
 
 		 453 aa  286  5e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  36.61 
 
 		 452 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  34.2 
 
 		 455 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  35.47 
 
 		 457 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.98 
 
 		 462 aa  286  7e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  35.47 
 
 		 457 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  35.47 
 
 		 457 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.27 
 
 		 457 aa  285  8e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  37.07 
 
 		 452 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  35.47 
 
 		 457 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  34.6 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  35.47 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  34.61 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  37.88 
 
 		 463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 489 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  36.84 
 
 		 452 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  34.74 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  34.74 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  34.74 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  34.85 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.85 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  34.85 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.56 
 
 		 460 aa  280  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  34.85 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  34.85 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  34.85 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  34.85 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  34.85 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  38.69 
 
 		 500 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.37 
 
 		 465 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  33.56 
 
 		 446 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  33.56 
 
 		 446 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  33.56 
 
 		 446 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  33.56 
 
 		 446 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  33.11 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  37.62 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  37.62 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  33.11 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  33.11 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  37.58 
 
 		 463 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  33.11 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  33.11 
 
 		 458 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4514  coproporphyrinogen III oxidase  34 
 
 		 457 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130289  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 464 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  33.48 
 
 		 446 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  37.79 
 
 		 476 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  33.26 
 
 		 446 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  35.19 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  36.13 
 
 		 481 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  37.36 
 
 		 463 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  36.92 
 
 		 510 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  36.66 
 
 		 462 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>